Dr. Enrique Merino Perez
Investigador Titular C Tiempo Completo
Bioinformática aplicada a las ciencias ómicas
Biología de sistemas
Biología sintética
Metagenómica ambiental
Regulación génica en bacterias
Número de registros: 21
- Activos
- Vencidos
- Descubriendo nuevos paradigmas de la regulación genética basada en rnas pequeños y chaperonas de rna en organismos procariontes, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2023 - 2025
- Plasticidad genómica de aislados clínicos secuenciales del hongo patógeno de humanos candida glabrata: consecuencias para la resistencia a antifúngicos y la capacidad de adhesión, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2021 - 2023
- Identificación in silico y caracterización molecular de la regulación genética basada en riboswit-ches que actúan in trans (trans-acting riboswitches) o que se transcriben en sentido opuesto al de su gen blanco (antisene-acting riboswitches), CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2020 - 2022
- Regulación de la expresión genética basada en riboswitch t-box en firmicutes y otras bacterias gram-positivas, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2017 - 2020
- Identificación in silico y caracterización molecular de la regulación genética basada en riboswitches que actúan en trans (trans-acting riboswitches) o que se transcriben es en sentido opuesto al de su gen blanco (antisene-acting riboswitches), DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2020 - 2022
- Generando nuevos paradigmas dentro de la biología sintética aplicados al estudio de estresomas celulares, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2016 - 2019
- Desarrollo de un nuevo enfoque computacional para la identificación de sitios de unión de factores transcripcionales bacterianos y su corroboración experimental en miembros de la familia lysr, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2015 - 2018
- Analisis de genomas y proteomas, PRESUPUESTO UNAM, 2014 - 2020
- Desarrollo de un nuevo enfoque computacional para la identificación de sitios de unión de factores transcripcionales bacterianos. la familia de regulación lysr como modelo de estudio, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2014 - 2017
- Regulación de la expresión genética basada en riboswitches, identificación in silico y su caracterización funcional, molecular y cinética, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2012 - 2015
- Análisis de la energía de desestabilización y curvatura estática del dna como elementos de la regulación transcripcional en genomas y metagenomas, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2011 - 2013
- Termoriboswitches: moleculas de rna regulatorias responsivas a temperatura, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2009
- Riboswitches como blancos de nuevos agentes antimicrobianos, FONDO SECTORIAL DE INVESTIGACIÓN EN SALUD Y SEGURIDAD SOCIAL, 2008 - 2011
- Análisis de la curvatura estática del dna, genomas y metagenomas, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2008 - 2010
- Identificación in silico y caracterización molecular, estructural y cinética de elementos de regulación de la expresión genética basada en riboswitches, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2007 - 2010
- Análisis de la curvatura estática del dna. 4a. etapa., DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2005 - 2007
- Predicción de redes de regulación mediante genómica comparativa, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2004 - 2006
- Análisis de la curvatura estática del dna cromosomal. estudio genoma, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2004 - 2005
- Análisis de la curvatura estática del dna cromosomal. estudio evolutivo y posible función en el genoma. tercera etapa., DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2003 - 2004
- Análisis de la curvatura estátita del dna cromosomal. estudio evolutivo y posible función en el genoma. segunda etapa., DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2000 - 2002
- Análisis de la curvatura estátita del dna cromosomal. estudio evolutivo y posible función en el genoma, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 1998 - 2000
Nivel D del PRIDE
Nivel III del SNII
Nivel III del SNII
Doctorado, en Biotecnología, Colegio de Ciencias y Humanidades-CEINGEBI-IBt-UNAM, 1993
Maestría, en Investigacion Biomedica Basica, Colegio de Ciencias y Humanidades-CEINGEBI-UNAM (1988)
Licenciatura, Ingeniería Civil, Fac. de Ingeniería-UNAM (1982)
- Activos
- Graduados
-
Doctorado
-
Estudio de estresomas en Bacillus subtilis mediante el uso de riboreguladores artificiales
-
M.C. Joselyn Cristina Chavez Fuentes
Identificación in silico y análisis funcional de elementos de regulación transcripcional en el superfilum Planctomycetes-Verrucomicobria-Chlamydiae (PVC). -
M.C. Walter Josue Hernandez Santos
"Estudio de la expresión genética mediada por sRNAs en procariotas mediante el análisis de datos de secuenciación masiva e inteligencia artificial" -
Caracterización funcional de riboswitches T-box en Firmicutes y otras bacterias Gram positivas.
-
Maestría
-
Licenciatura
-
Estancia Temporal
1 - Serrano Gutierrez, Mariela (2024). Identificacion in silico y caracterizacion molecular de la regulacion genetica basada en riboswitches que se transcriben en sentido opuesto al de su gen blanco (antisense-acting riboswitches).
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
2 - Estrada Guerra, Karel Johan (2024). Análisis in silico de las secuencias de unión a ribosoma que definen el inicio de la traducción en procariontes.
Instituto de Investigacion en Ciencias Basicas y Aplicadas,
Doctorado en Ciencias,
UAEM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
3 - Barcelo Antemate, Diana (2023). Efecto del sesgo del contenido de GC genómico de organismos procariotas en las estructuras secundarias de sus proteínas.
Instituto de Investigacion en Ciencias Bascias y Aplicadas,
Doctorado en Ciencias,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
4 - Chavez Fuentes, Joselyn Cristina (2021). Analisis de los elementos de regulacion transcripcional a traves de los phyla bacterianos y de archaeas.
Instiotuto de Biotecnología,
Doctorado en Ciencias Bioquímicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
5 - Sánchez Olmos, Maria del Carmen (2020). Implementación de un nuevo método para la integración cromosómica múltiple y sucesiva de elementos genéticos :
un enfoque para la creación de circuitos epigenéticos en biología sintética .
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Pérez, Enrique
6 - Carrera Reyna, Maricela (2020). Identificacion de promotores sigma 54 bacterianos con base en la conservacion de secuencia nucleotidica .
Instituto de Biotecnologia,
Maestría en Ciencias Bioquímicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
7 - Rodriguez Garcia, Edgar (2019). Identificacion de riboswitches que actuan in cis e in trans en genomas bacterianos .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
8 - Hernandez Santos, Walter Josue (2019). Analisis del papel de las chaperonas de RNA en la regulacion mediada por sRNAs en bacterias .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
9 - Rodriguez Mejia, Jose Luis (2017). Analisis del efecto de estructuras secundarias alrededor del sitio de union a ribosoma sobre la traduccion de proteinas GFP como caso de estudio .
Centro de Ciencias Genomicas,
Doctorado en Ciencias Biomedicas,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
10 - Rodriguez Escamilla, Zuemy (2017). Ingenieria de sistemas de regulacion genetica en organismos bacterianos mediante sRNA pequenos y la proteina chaperona de RNA Hfq .
Centro de Ciencias Genomicas,
Doctorado en Ciencias Biomedicas,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
11 - Peguero Sanchez, Esteban (2017). Prediccion de sitios de entrada internos al ribosoma en eucariontes .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
12 - Oliver Ocano, Patricia Maria Rufina (2017). Desarrollo de una nueva estrategia para la prediccion de sitios de union de factores transcripcionales en bacterias, basado en el analisis de huellas filogeneticas y su caracterizacion biologica : la familia LysR como modelo de estudio.
Centro de Ciencias Genomicas,
Doctorado en Ciencias Biomedicas,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
13 - Estrada Guerra, Karel Johan (2017). Identificación in silico de elementos de regulación en secuencias de organismos bacterianos .
Instituto de Investigacion en Ciencias Basicas y Aplicadas,
UAEM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
14 - Gutierrez Preciado, Ana Lucia (2013). Identificacion de la funcion de los genes a partir de la especificidad del riboswitch t box .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Biomedicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
15 - Taboada Ramirez, Blanca Itzelt (2012). Identificacionin silicode operonesen genomas bacterianos basadaen redes neuronales .
Doctora en Ciencias (Computacion),
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique, Verde Rodarte, Maria Cristina
16 - Quintana Kageyama, Jorge Enrique (2012). Evolucion in silico de interacciones proteina ligando : profilina/polilprolina como modelo de estudio .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
17 - Martinez Nunez, Mario Alberto (2011). Divergencia de los sistemas de regulacion en secuencias paralogas en bacterias : una perspectiva genomica .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
18 - Avila Magana, Viridiana (2011). Identificacion in silico de nuevos sitios de entrada para el ribosoma en genomas eucariontes .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
19 - Avila Magana, Viridiana (2009). Termoriboswitches : moleculas de RNA regulatorias responsivas a temperatura.
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
20 - Oliver Ocano, Patricia Maria Rufina (2008). Analisis de operones divergentes conservados en procariontes para la identificacion de potenciales sitios de union a factores transcripcionales.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
21 - Rodriguez Escamilla, Zuemy (2007). Diseno y construccion de riboswitches sinteticos.
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
22 - Martinez Nunez, Mario Alberto (2007). Subdivision de grupos COGs con presencia de paralogos en subfamilias de proteinas.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
23 - Olivares Zavaleta, Norma (2006). Analisis genomico de elementos de curvatura en secuencias promotoras de escherichia coli K12 y su aplicacion al caso de hns.
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
24 - Abreu Goodger, Cei (2005). Senales conservadas en regiones intergenicas bacterianas : riboswitches y mas alla .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
25 - Ontiveros Palacios, Nancy Guadalupe (2004). Identificacion de secuencias de regulacion riboswitches en operaciones de la biosintesis de vitaminas y cofactores.
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
26 - Jauregui Sandoval, Ruy (2003). Analisis de la curvatura estatica del DNA genomico .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
27 - Cortez Quezada, Diego Claudio (2002). Estudio de las secuencias extragenicas palindromicas repetidas en los genomas procariontes.
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
28 - Sampieri Hernandez, Aristides, III (2001). Analisis de la region 5o de regulacion del Gen aprE de basillus subtilis .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias (Bioquimica),
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
29 - Abreu Goodger, Cei (2001). Analisis de la distribucion de los sitios de metilacion DAM y DCM en el genoma completo de Escherichia coli y su posible implicacion biologica .
Instituto de Biotecnologia,
Licenciatura en Investigacion Biomedica Basica,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
30 - Jan Roblero, Janet (2000). Diseno y construccion de cepas de Bacillis subtilis sobreproductoras de proteinas heterologas.
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias (Bioquimica),
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
Total de publicaciones: 105
- Tipo
- Fecha
Artículo
Artículo
32 - Estrada,K., Garciarrubio,A., Merino,E. (2024). Unraveling the Plasticity of Translation Initiation in Prokaryotes: Beyond the Invariant Shine-Dalgarno Sequence.
PLoS ONE,
19 (1),
e0289914.
Artículo
33 - Guadarrama-Perez,V., Aguilar,C., Porras-Sanjuanico,A., Merino,E., Ramirez,O.T., Barona-Gomez,F., Palomares,L.A. (2024). Expression in CHO cells of a bacterial biosynthetic pathway producing a small non-ribosomal peptide aldehyde prevents proteolysis of recombinant proteins.
Metabolic Engineering,
82,
79-88.
Artículo
34 - Guillen-Chable,F., Valdez Iuit,J.O., Avila Castro,L.A., Rosas,C., Merino,E., Rodriguez-Escamilla,Z., Martinez-Nunez,M.A. (2024). Geographical distribution of mobile genetic elements in microbial communities along the Yucatan coast.
PLoS ONE,
19 (4),
e0301642.
Artículo
35 - Barcelo-Antemate,D., Fontove-Herrera,F., Santos,W., Merino,E. (2023). The effect of the genomic GC content bias of prokaryotic organisms on the secondary structures of their proteins.
PLoS ONE,
18 (5),
e0285201,
e0285201.
Artículo
36 - Chowdhury-Paul,S., Martinez-Ortiz,I.C., Pando-Robles,V., Moreno,S., Espin,G., Merino,E., Nunez,C. (2023). The Azotobacter vinelandii AlgU regulon during vegetative growth and encysting conditions: A proteomic approach.
PLoS ONE,
18 (11),
e0286440.
Artículo
37 - Rivas-Marin,E., Moyano-Palazuelo,D., Henriques,V., Merino,E., Devos,D.P. (2023). Essential gene complement of Planctopirus limnophila from the bacterial phylum Planctomycetes.
Nature Communications,
14 (1),
7224.
Artículo
38 - Serrano-Gutierrez,M., Merino,E. (2023). Antisense-acting riboswitches: A poorly characterized yet important model of transcriptional regulation in prokaryotic organisms.
PLoS ONE,
18 (2),
e0281744.
Artículo
39 - Loza,A., Garcia-Guevara,F., Segovia,L., Escobar-Zepeda,A., Sanchez-Olmos,M.D.C., Merino,E., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L., Juarez,K., Gutierrez-Rios,R.M. (2022). Definition of the Metagenomic Profile of Ocean Water Samples From the Gulf of Mexico Based on Comparison With Reference Samples From Sites Worldwide.
Frontiers in Microbiology,
12,
781497.
Artículo
40 - Angel-Lerma,L.E., Merino,E., Kwon,O., Medina-Aparicio,L., Hernandez-Lucas,I., Alvarez,A.F., Georgellis,D. (2021). Protein dosage of the lldPRD operon is correlated with RNase E-dependent mRNA processing.
Journal of Bacteriology,
203 (6),
e00555-20.
Artículo
41 - Chavez,J., Devos,D.P., Merino,E. (2021). Complementary tendencies in the use of regulatory elements (transcription factors, sigma factors, and riboswitches) in Bacteria and Archaea.
Journal of Bacteriology,
203 (2),
e00413-20.
Artículo
42 - Tenorio-Salgado,S., Castelan-Sanchez,H.G., Davila-Ramos,S., Huerta-Saquero,A., Rodriguez-Morales,S., Merino-Perez,E., Roa de la Fuente LF, Solis-Pereira,S.E., Perez-Rueda,E., Lizama-Uc,G. (2021). Metagenomic analysis and antimicrobial activity of two fermented milk kefir samples.
Microbiologyopen,
10 (2),
e1183.
Artículo
43 - Raggi,L., Garcia-Guevara,F, Godoy-Lozano,E.E., Martinez-Santana,A., Escobar-Zepeda,A., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Merino,E., Sanchez-Flores,A., Licea-Navarro,A., Pardo-Lopez,L., Segovia,L., Juarez,K. (2020). Metagenomic Profiling and Microbial Metabolic Potential of Perdido Fold Belt (NW) and Campeche Knolls (SE) in the Gulf of Mexico.
Frontiers in Microbiology,
11.
Artículo
44 - Martinez-Amador,P., Castaneda,N., Loza,A., Soto,L., Merino,E., Gutierrez-Rios,R.M. (2019). Prediction of protein architectures involved in the signaling-pathway initiating sporulation in Firmicutes.
BMC Research Notes,
12 (1),
686,
686.
Artículo
45 - Soto-Aceves,M.P., Cocotl-Yanez,M., Merino,E., Castillo-Juarez,I., Cortes-Lopez,H., Gonzalez-Pedrajo,B., Diaz-Guerrero,M., Servin-Gonzalez,L., Soberon-Chavez,G. (2019). Inactivation of the quorum-sensing transcriptional regulators LasR or RhlR does not suppress the expression of virulence factors and the virulence of Pseudomonas aeruginosa PAO1.
Microbiology,
165 (4),
425-432.
Artículo
46 - Escobar-Zepeda, A., Godoy-Lozano, E.E., Raggi, L., Segovia, L., Merino, E., Gutierrez-Rios, R.M., Juarez, K., Licea-Navarro, A.F., Pardo-Lopez, L., Sanchez-Flores, A. (2018). Analysis of sequencing strategies and tools for taxonomic annotation: Defining standards for progressive metagenomics.
Scientific Reports,
8 (1),
12034.
Artículo
47 - Godoy-Lozano,E.E., Escobar-Zepeda,A., Raggi,L., Merino,E., Gutierrez-Rios,R.M., Juarez,K., Segovia,L., Licea-Navarro,A.F., Gracia,A., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L. (2018). Bacterial diversity and the geochemical landscape in the southwestern Gulf of Mexico.
Frontiers in Microbiology,
9 (OCT),
2528.
Artículo
48 - Taboada, B., Estrada, K., Ciria, R., Merino, E. (2018). Operon-mapper: A Web Server for Precise Operon Identification in Bacterial and Archaeal Genomes.
Bioinformatics,
34 (23),
4118?4120.
Artículo
49 - Gutierrez-Preciado, A., Vargas-Chavez, C., Reyes-Prieto, M., Ordonez, O.F., Santos-Garcia, D., Rosas-Perez, T., Valdivia-Anistro, J., Rebollar, E.A., Saralegui, A., Moya, A., Merino, E., Farias, M.E., Latorre, A., Souza, V. (2017). The genomic sequence of Exiguobacterium chiriqhucha str. N139 reveals a species that thrives in cold waters and extreme environmental conditions.
PeerJ,
5,
e3162.
Revisión
50 - Merino, E., Flores-Encarnacion, M., Aguilar-Gutierrez, G.R. (2017). Functional interaction and structural characteristics of unique components of Helicobacter pylori T4SS.
Febs Journal,
284 (21),
3540-3549.
Artículo
51 - Pannier, L., Merino, E., Marchal, K., Collado-Vides, J. (2017). Effect of genomic distance on coexpression of coregulated genes in E. coli.
PLoS ONE,
12 (4),
e0174887.
Artículo
52 - Rodriguez-Mejia, J.L., Roldan-Salgado, A., Osuna, J., Merino, E., Gaytan, P. (2017). A Codon Deletion at the Beginning of Green Fluorescent Protein Genes Enhances Protein Expression.
Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology,
27 (1),
1-10.
Artículo
53 - Vega-Cabrera, L.A., Guerrero, A., Rodriguez-Mejia, J.L., Tabche, M.L., Wood, C.D., Gutierrez-Rios, R.M., Merino, E., Pardo-Lopez, L. (2017). Analysis of Spo0M function in Bacillus subtilis.
PLoS ONE,
12 (2),
e0172737.
Artículo
54 - Zappulo, A., van den, Bruck D., Ciolli, Mattioli C., Franke, V., Imami, K., McShane, E., Moreno-Estelles, M., Calviello, L., Filipchyk, A., Peguero-Sanchez, E., Muller, T., Woehler, A., Birchmeier, C., Merino, E., Rajewsky, N., Ohler, U., Mazzoni, E.O., Selbach, M., Akalin, A., Chekulaeva, M. (2017). RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome.
Nature Communications,
8 (1),
583.
Artículo
55 - Mucito-Varela,E., Castillo-Rojas,G., Cevallos,M.A., Lozano,L., Merino,E., Lopez-Leal,G., Lopez-Vidal,Y. (2016). Complete Genome Sequence of Helicobacter pylori Strain 7C Isolated from a Mexican Patient with Chronic Gastritis.
Genome Announcements,
4 (1).
Artículo
56 - Oliver,P., Peralta-Gil,M., Tabche,M.L., Merino,E. (2016). Molecular and structural considerations of TF-DNA binding for the generation of biologically meaningful and accurate phylogenetic footprinting analysis: the LysR-type transcriptional regulator family as a study model.
BMC Genomics,
17,
686.
Artículo
57 - Rodriguez-Escamilla,Z., Martinez-Nunez,M.A., Merino,E. (2016). Epigenetics knocks on synthetic biology's Door.
Fems Microbiology Letters,
363 (17),
fnw191.
Artículo
58 - Gutierrez-Preciado,A., Torres,A.G., Merino,E., Bonomi,H.R., Goldbaum,F.A., Garcia-Angulo,V.A. (2015). Extensive Identification of Bacterial Riboflavin Transporters and Their Distribution across Bacterial Species.
PLoS ONE,
10 (5),
e0126124.
Artículo
59 - Moran,J., Ramirez,G., Jimenez,L., Cruz,A., Perez-Patrigeon,S., Hidalgo,A., Orozco,L., Martinez,A., Padilla,L., Avila-Moreno,F., Cabello,C., Granados,J., Ortiz-Quintero,B., Ramirez-Venegas,A., Ruiz-Palacios,G.M., Zlotnik,A., Merino,E., Zuniga,J. (2015). Circulating levels of miR-150 are associated with poorer outcomes of A/H1N1 infection.
Experimental and Molecular Pathology,
99 (2),
253-261.
Artículo
60 - Peguero-Sanchez,E., Pardo-Lopez,L., Merino,E. (2015). IRES-dependent translated genes in fungi: computational prediction, phylogenetic conservation and functional association.
BMC Genomics,
16 (1),
1059.
Artículo
61 - Grosso-Becerra,M.V., Croda-Garcia,G., Merino,E., Servin-Gonzalez,L., Mojica-Espinosa,R., Soberon-Chavez,G. (2014). Regulation of Pseudomonas aeruginosa virulence factors by two novel RNA thermometers.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,
111 (43),
15562-15567.
Artículo
62 - Barraza,A., Estrada-Navarrete,G., Rodriguez-Alegria,M.E., Lopez-Munguia,A., Merino,E., Quinto,C., Sanchez,F. (2013). Down-regulation of PvTRE1 enhances nodule biomass and bacteroid number in the common bean.
New Phytologist,
197 (1),
194-206.
Artículo
63 - Freyre-Gonzalez,J.A., Manjarrez-Casas,A.M., Merino,E., Martinez-Nunez,M., Perez-Rueda,E., Gutierrez-Rios,R.M. (2013). Lessons from the modular organization of the transcriptional regulatory network of Bacillus subtilis.
BMC Systems Biology,
7 (1),
127.
Artículo
64 - Gutierrez-Preciado,A., Merino,E. (2012). Elucidating metabolic pathways and digging for genes of unknown function in microbial communities: the riboswitch approach.
Clinical Microbiology and Infection,
18 Suppl 4,
35-39.
Artículo
65 - Taboada,B., Ciria,R., Martinez-Guerrero,C.E., Merino,E. (2012). ProOpDB: Prokaryotic Operon DataBase.
Nucleic Acids Research,
40 (1),
D627-D631.
Revisión
66 - Martinez-Nunez,M.A., Perez-Rueda,E., Gutierrez-Rios,R.M., Merino,E. (2010). New insights into the regulatory networks of paralogous genes.
Microbiology,
156 (1),
14-22.
Artículo
67 - Taboada,B., Verde,C., Merino,E. (2010). High accuracy operon prediction method based on STRING database scores.
Nucleic Acids Research,
3812 (E130).
Artículo
68 - De la Cruz,M.A., Merino,E., Oropeza,R., Tellez,J., Calva,E. (2009). The DNA static curvature has a role in the regulation of the ompS1 porin gene in Salmonella enterica serovar Typhi.
Microbiology,
155 (7),
2127-2136.
Revisión
69 - Gutierrez-Preciado,A., Henkin,T.M., Grundy,F.J., Yanofsky,C., Merino,E. (2009). Biochemical Features and Functional Implications of the RNA-Based T-Box Regulatory Mechanism.
Microbiology and Molecular Biology Reviews,
73 (1),
36-61.
Artículo
70 - Qu,Y., Brown,P., Barbe,J.F., Puljic,M., Merino,E., Adkins,R.M., Lovley,D.R., Krushkal,J. (2009). GSEL version 2, an online genome-wide query system of operon organization and regulatory sequence elements of Geobacter sulfurreducens.
OMICS,
13 (5),
439-449.
Artículo
71 - Romero-Garcia,S., Hernandez-Bustos,C., Merino,E., Gosset,G., Martinez,A. (2009). Homolactic fermentation from glucose and cellobiose using Bacillus subtilis.
Microbial Cell Factories,
8 (1),
23.
Artículo
72 - Arreola,R., Vega-Miranda,A., Gomez-Puyou,A., Perez-Montfort,R., Merino-Perez,E., Torres-Larios,A. (2008). Expression, purification and preliminary X-ray diffraction studies of the transcriptional factor PyrR from Bacillus halodurans.
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications,
64 (Pt 8),
692-696.
Artículo
73 - FLORES,N., Escalante,A., de Anda,R., Baez-Viveros,J.L., Merino,E., Franco,B., Georgellis,D., Gosset,G., Bolivar,F. (2008). New Insights into the Role of Sigma Factor RpoS as Revealed in Escherichia coli Strains Lacking the Phosphoenolpyruvate:Carbohydrate Phosphotransferase System.
Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology,
14 (4),
176-192.
Artículo
74 - Gama-Castro,S., Jimenez-Jacinto,V., Peralta-Gil,M., Santos-Zavaleta,A., Penaloza-Spinola,M.I., Contreras-Moreira,B., Segura-Salazar,J., Muniz-Rascado,L., Martinez-Flores,I., Salgado,H., Bonavides-Martinez,C., Abreu-Goodger,C., Rodriguez-Penagos,C., Miranda-Rios,J., Morett,E., Merino,E., Huerta,A.M., Trevino-Quintanilla,L., Collado-Vides,J. (2008). RegulonDB (version 6.0): gene regulation model of Escherichia coli K-12 beyond transcription, active (experimental) annotated promoters and Textpresso navigation.
Nucleic Acids Research,
36 (Database issue),
D120-D124.
Artículo
75 - Martinez-Guerrero,C.E., Ciria,R., Abreu-Goodger,C., Moreno-Hagelsieb,G., Merino,E. (2008). GeConT 2: gene context analysis for orthologous proteins, conserved domains and metabolic pathways.
Nucleic Acids Research,
36 (Web Server issue) ((Web Server issue)),
W176-W180.
Revisión
76 - Merino,E., Jensen,R.A., Yanofsky,C. (2008). Evolution of bacterial trp operons and their regulation.
Current Opinion in Microbiology,
11 (2),
78-86.
Artículo
77 - Rodriguez-Magadan,H., Merino,E., Schnabel,D., Ramirez,L., Lomeli,H. (2008). Spatial and temporal expression of Zimp7 and Zimp10 PIAS-like proteins in the developing mouse embryo.
Gene Expression Patterns,
8 (3),
206-213.
Artículo
78 - Gutierrez-Preciado,A., Yanofsky,C., Merino,E. (2007). Comparison of tryptophan biosynthetic operon regulation in different Gram-positive bacterial species.
Trends in Genetics,
23 (9),
422-426.
Artículo
79 - Romero,S., Merino,E., Bolivar,F., Gosset,G., Martinez,A. (2007). Metabolic engineering of Bacillus subtilis for ethanol production: Lactate dehydrogenase plays a key role in the fermentative metabolism.
Applied and Environmental Microbiology,
73 (16),
5190-5198.
Artículo; Actas Paper
80 - Abreu-Goodger,C., Merino,E. (2006). Identification of bacteria riboswitches through comparative genomics.
Revista Latinoamericana de Microbiologia,
48 (2),
143-145.
Artículo
81 - Olivares-Zavaleta,N., Jauregui,R., Merino,E. (2006). Genome analysis of Escherichia coli promoter sequences evidences that DNA static curvature plays a more important role in gene transcription than has previously been anticipated.
Genomics,
87 (3),
329-337.
Artículo
82 - Abreu-Goodger,C., Merino,E. (2005). RibEx: a web server for locating riboswitches and other conserved bacterial regulatory elements.
Nucleic Acids Research,
33 (Web Server Issue),
W690-W692.
Artículo
83 - Gutierrez-Preciado,A., Jensen,R.A., Yanofsky,C., Merino,E. (2005). New insights into regulation of the tryptophan biosynthetic operon in Gram-positive bacteria.
Trends in Genetics,
21 (8),
432-436.
Artículo
84 - Merino,E., Yanofsky,C. (2005). Transcription attenuation: a highly conserved regulatory strategy used by bacteria.
Trends in Genetics,
21 (5),
260-264.
Artículo
85 - Abreu-Goodger,C., Ontiveros-Palacios,N., Ciria,R., Merino,E. (2004). Conserved regulatory motifs in bacteria: riboswitches and beyond.
Trends in Genetics,
20 (10),
475-479.
Artículo
86 - Ciria,R., Abreu-Goodger,C., Morett,E., Merino,E. (2004). GeConT: gene context analysis.
Bioinformatics,
20 (14),
2307-2308.
Artículo
87 - Corona,M., Coronas,F.V., Merino,E., Becerril,B., Gutierrez,R., Rebolledo-Antunez,S., Garcia,D.E., Possani,L.D. (2003). A novel class of peptide found in scorpion venom with neurodepressant effects in peripheral and central nervous system of the rat.
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins & Proteomics,
1649 (1),
58-67.
Artículo
88 - Jauregui,R., Abreu-Goodger,C., Moreno-Hagelsieb,G., Collado-Vides,J., Merino,E. (2003). Conservation of DNA curvature signals in regulatory regions of prokaryotic genes.
Nucleic Acids Research,
31 (23),
6770-6777.
Artículo
89 - Corona,M., Gurrola,G.B., Merino,E., Cassulini,R.R., Valdez-Cruz,N.A., Garcia,B, Ramirez-Dominguez,M.E., Coronas,F.I., Zamudio,F.Z., Wanke,E., Possani,L.D. (2002). A large number of novel Ergtoxin-like genes and ERG K(+)-channels blocking peptides from scorpions of the genus Centruroides.
FEBS Letters,
532 (1-2),
121-126.
Artículo
90 - Corona,M., Valdez-Cruz,N.A., Merino,E., Zurita,M., Possani,L.D. (2001). Genes and peptides from the scorpion Centruroides sculpturatus Ewing, that recognize Na(+)-channels.
Toxicon,
39 (12),
1893-1898.
Artículo
91 - Jan,J., Valle,F., Bolivar,F., Merino,E. (2001). Construction of protein overproducer strains in Bacillus subtilis by an integrative approach.
Applied Microbiology and Biotechnology,
55 (1),
69-75.
Artículo
92 - Jan,J., Valle,F., Bolivar,F., Merino,E. (2000). Characterization of the 5 ' subtilisin (aprE) regulatory region from Bacillus subtilis.
Fems Microbiology Letters,
183 (1),
9-14.
Artículo
93 - Jauregui,R., Bolivar,F., Merino,E. (2000). Relationship between whole proteome aminoacid composition and static DNA curvature.
Microbial & comparative genomics,
5 (1),
7-15.
Artículo
94 - Merino,E., Garciarrubio,A. (2000). The global intrinsic curvature of archaeal and eubacterial genomes is mostly contained in their dinucleotide composition and is probably not an adaptation.
Nucleic Acids Research,
28 (12),
2431-2438.
Artículo
95 - Possani,L.D., Merino,E., Corona,M., Bolivar,F., Becerril,B. (2000). Peptides and genes coding for scorpion toxins that affect ion-channels.
Biochimie,
82 (9-10),
861-868.
Artículo
96 - Sarsero,J.P., Merino,E., Yanofsky,C. (2000). A Bacillus subtilis gene of previously unknown function, yhaG, is translationally regulated by tryptophan-activated TRAP and appears to be involved in tryptophan transport.
Journal of Bacteriology,
182 (8),
2329-2331.
Artículo
97 - Sarsero,J.P., Merino,E., Yanofsky,C. (2000). A Bacillus subtilis operon containing genes of unknown function senses tRNATrp charging and regulates expression of the genes of tryptophan biosynthesis.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,
97 (6),
2656-2661.
Artículo
98 - Jauregui,R., O'Reilly,F., Bolivar,F., Merino,E. (1998). Relationship between codon usage and sequence-dependent curvature of genomes.
Microbial & comparative genomics,
3 (4),
243-253.
Artículo
99 - Sanchez-Lopez,R., Gama-Castro,S., Ramos,M.A., Merino,E., Lizardi,P.M., Alagon,A. (1998). Cloning and expression of the Entamoeba histolytica ERD2 gene.
Molecular and Biochemical Parasitology,
92 (2),
355-359.
Artículo
100 - Merino,E., Babitzke,P., Yanofsky,C. (1995). trp RNA-binding attenuation protein (TRAP)-trp leader RNA interactions mediate translational as well as transcriptional regulation of the Bacillus subtilis trp operon.
Journal of Bacteriology,
177 (22),
6362-6370.
*
Artículo
101 - Ospina,S., Merino,E., Ramirez,O.T., Lopez-Munguia,A. (1995). Recombinant whole cell penicillin acylase biocatalyst: Production, characterization and use in the synthesis and hydrolysis of antibiotics.
Biotechnology Letters,
17 (6),
615-620.
Artículo
102 - Merino,E., Balbas,P., Puente,J.L., Bolivar,F. (1994). Antisense overlapping open reading frames in genes from bacteria to humans.
Nucleic Acids Research,
22 (10),
1903-1908.
Artículo
103 - Ramirez,O.T., Zamora,R., Espinosa,G., Merino,E., Bolivar,F., Quintero,R. (1994). Kinetic study of penicillin acylase production by recombinant E. Coli in batch cultures.
Process Biochemistry,
29 (3),
197-206.
Artículo
104 - FLORES,N., Valle,F., Bolivar,F., Merino,E. (1992). Recovery of DNA from agarose gels stained with methylene blue.
Biotechniques,
13 (2),
203-205.
Artículo
105 - Merino,E., Osuna,J., Bolivar,F., Soberon,X. (1992). A general, PCR-based method for single or combinatorial oligonucleotide-directed mutagenesis on pUC/M13 vectors.
Biotechniques,
12 (4),
508-510.
Artículo
106 - Merino,E., Balbas,P., Aarons,S.R., Recillas,F., Becerril,B., Valle,F., Bolivar,F. (1992). Carbon regulation and the role in nature of the Escherichia coli penicillin acylase (pac) gene.
Molecular Microbiology,
6 (15),
2175-2182.
Artículo
107 - Merino,E., Balbas,P., Bolivar,F. (1991). New insights on the comma-less theory.
Origins of Life and Evolution of the Biosphere,
21 (4),
251-254.
Revisión
108 - Valle,F., Balbas,P., Merino,E., Bolivar,F. (1991). The role of penicillin amidases in nature and in industry.
Trends in Biochemical Sciences,
16 (1),
36-40.
Artículo
109 - Gosset,G., Merino,E., Recillas,F., Oliver,G., Becerril,B., Bolivar,F. (1989). Amino acid sequence analysis of the glutamate synthase enzyme from Escherichia coli K-12.
Protein sequences & data analysis,
2 (1),
9-16.
Note
110 - Merino,E., Bolivar,F. (1989). The ribonucleoside diphosphate reductase gene (nrdA) of Escherichia coli carries a repetitive extragenic palindromic (REP) sequence in its 3' structural terminus.
Molecular Microbiology,
3 (6),
839-841.
Note
Artículo
112 - Balbas,P., Soberon,X., Merino,E., Zurita,M., Lomeli,H., Valle,F., FLORES,N., Bolivar,F. (1986). Plasmid vector pBR322 and its special-purpose derivatives--a review.
Gene,
50 (1-3),
3-40.
Artículo
113 - Becerril,B., Valle,F., Merino,E., Riba,L., Bolivar,F. (1985). Repetitive extragenic palindromic (REP) sequences in the Escherichia coli gdhA gene.
Gene,
37 (1-3),
53-62.
Internacional
114 - Merino,E., Jensen,R.A., Yanofsky,C. (2013). trp Operon Organization and Regulation in Different Bacterial Species. Brenner's Encyclopedia of Genetics (Second Edition).
208-212,
San Diego.
Memoria in extenso
115 - Ciuffo,L.N., Alves,L., Alves de Melo,A.C., Aparicio,G., Arce,P., Blanquer,I., Burbano,D.A., Carrion,A., Castro,H., Hernandez,V., Hurtado,J.M., Isea,R., Lagares,J.I., Lopez-Fenner,J., Mayo,R., Merino,E., Montes,E., Nogales-Cadenas,I., Oliviera,I., Pascual-Montano,A., Perez,M.A., Pezoa,R., Roa,J.C., Romero,F., Rubio-Montero,J.A., Salinas,L., Tirado,F., Verleyen,J., Vicente-Molina,C., Walter,W.E. (2009). Biomedical applications in the EELA-2 project. NETTAB 2009 Ninth Annual Workshop Network Tools and Applications in Biology, 10-12 June 2009, Catania, Italy.
Liberodescrivere,
35-38.
Internacional
116 - Gutierrez-Preciado,A., Peimbert,M., Merino,E. (2009). Genome Sequence Databases: Types of Data and Bioinformatic Tools. Encyclopedia of Microbiology.
211-236,
3a,
Oxford.
Memoria in extenso
117 - Verleyen,J., Hurtado-Ramirez,J.M., Merino-Perez,E. (2009). Meta-Dock, a gridification of a docking application. Proceedings of the First EELA-2.
147-153.
Nacional
118 - Gutierrez,R.M., Merino,E. (2008). Genes, genomas y metagenomas: de Mendel a Venter. Una ventana al quehacer científico. Instituto de Biotecnología de la UNAM 25 aniversario, cap 7.
70-80,
Mexico, D.F..
Nacional
119 - Merino,E. (2004). Las matematicas en la genomica molecular. Las matematicas y su entorno.
67-88,
Mexico.
Internacional
120 - Devos,D, Merino,E., Pazos,F, Valencia,A. (2003). Multiple Sequence Alignment Information in Structure and Function Prediction. Artificial intelligence and heuristic methods in bioinformatics.
NATO Science Series. Series III, Computer and systems sciences, 1387-6694 ; v. 183,
83-94,
Amsterdam.
Internacional
Internacional
122 - Merino,E., Yanofsky,C. (2002). Regulation by termination-antitermination: a genomic approach. Bacillus subtilis and Its Closest Relatives: from Genes to Cells .
323-326,
Washington.
Internacional
123 - Possani,L.D., Merino,E., Corona,M., Becerril,B. (2002). Scorpion genes and peptides specific for potassium channels: Structure, function and evolution. Perspectives in Molecular Toxinology.
201-214.
Internacional
124 - Babitsky,P, Gollnick,P, Merino,E., Yanofsky,C. (2001). Aromatic amino acid metabolism in Bacillus Subtilis. Bacillus subtilis and its closest relatives: from genes to cells.
233-244,
New York.
Libro nacional
Nacional
126 - Serrano-Gutierrez,M., Merino,E. (2024). Riboswitches antisentido o de cómo la evolución adapta mecanismos de regulación para obtener respuestas antagónicas.
Biotecnologia,
28 (1),
9-18.
Preprint
127 - Chowdhury,S., Martinez-Ortiz,I.C., Pando-Robles,V., Moreno,S., Espin,G., Merino,E., Nunez,C. (2023). The Azotobacter vinelandii AlgU Regulon During Vegetative Growth and Encysting Conditions: A Proteomic Approach.
bioRxiv,
Preprint posted May 17.
Nacional
128 - Morales,N., Merino,E. (2020). Riboswitches: sensores e interruptores bacterianos.
BioTecnologia. Sociedad Mexicana de Biotecnologia y Bioingenieria,
24 (2),
8-28.
Divulgación
129 - Peguero-Sanchez,E., Pardo-Lopez,L., Merino-Perez,E. (2016). Descifrando el lenguaje de la vida.
Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM,
4,
3-4.
Divulgacion nacional
130 - Burlak,G., Martinez-Guerrero, C.E., Merino-Perez, E. (2013). Mini-BLAST: computer systems to search
for the pattern sequences in the bioinformatics databases.
Programacion Matematica y Software,
5 (2),
1-5.
Divulgación
131 - Merino,E. (2003). Analisis de secuencias en la era genomica.
Revista de la Universidad Nacional Autónoma de M?xico,
629,
15-23.
Divulgación
132 - Merino,E. (2003). Análisis de secuencias en la era genómica. Una mirada hacia el pasado.
Revista Universidad de Mexico,
629.
Editorial Material
133 - Rodriguez de la Vega,R.C., Merino,E., Becerril,B., Possani,L.D. (2003). Novel interactions between K(+) channels and scorpion toxins.
Trends in Pharmacological Sciences,
24 (5),
222-227.
134 - Merino Perez, Enrique (1992). Caracterizacion, manipulacion y posible papel en la naturaleza del gene pac y su producto, la enzima penicilino acilasa del Escherichia coli .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Biotecnologia,
UNAM.
Asesor: Bolivar Zapata, Francisco
135 - Merino Perez, Enrique (1988). Estudio de las secuencias palindromicas repetidas extragenicas (REP) en el genoma procarionte .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Investigacion Biomedica Basica,
UNAM.
Asesor: Bolivar Zapata, Francisco
Artículo
136 - Dorantes-Torres,C., Carrera-Reyna,M., Santos,W., Sanchez-Lopez,R., Merino,E.. PhyloString: A web server designed to identify, visualize, and evaluate functional relationships between orthologous protein groups across different phylogenetic lineages.
PLoS ONE,
19 (1),
e0297010.
Artículo
137 - Estrada,K., Garciarrubio,A., Merino,E.. Unraveling the Plasticity of Translation Initiation in Prokaryotes: Beyond the Invariant Shine-Dalgarno Sequence.
PLoS ONE,
19 (1),
e0289914.
Artículo
138 - Guadarrama-Perez,V., Aguilar,C., Porras-Sanjuanico,A., Merino,E., Ramirez,O.T., Barona-Gomez,F., Palomares,L.A.. Expression in CHO cells of a bacterial biosynthetic pathway producing a small non-ribosomal peptide aldehyde prevents proteolysis of recombinant proteins.
Metabolic Engineering,
82,
79-88.
Artículo
139 - Guillen-Chable,F., Valdez Iuit,J.O., Avila Castro,L.A., Rosas,C., Merino,E., Rodriguez-Escamilla,Z., Martinez-Nunez,M.A.. Geographical distribution of mobile genetic elements in microbial communities along the Yucatan coast.
PLoS ONE,
19 (4),
e0301642.
Nacional
140 - Serrano-Gutierrez,M., Merino,E.. Riboswitches antisentido o de cómo la evolución adapta mecanismos de regulación para obtener respuestas antagónicas.
Biotecnologia,
28 (1),
9-18.
Artículo
141 - Barcelo-Antemate,D., Fontove-Herrera,F., Santos,W., Merino,E.. The effect of the genomic GC content bias of prokaryotic organisms on the secondary structures of their proteins.
PLoS ONE,
18 (5),
e0285201,
e0285201.
Artículo
142 - Chowdhury-Paul,S., Martinez-Ortiz,I.C., Pando-Robles,V., Moreno,S., Espin,G., Merino,E., Nunez,C.. The Azotobacter vinelandii AlgU regulon during vegetative growth and encysting conditions: A proteomic approach.
PLoS ONE,
18 (11),
e0286440.
Artículo
143 - Rivas-Marin,E., Moyano-Palazuelo,D., Henriques,V., Merino,E., Devos,D.P.. Essential gene complement of Planctopirus limnophila from the bacterial phylum Planctomycetes.
Nature Communications,
14 (1),
7224.
Artículo
144 - Serrano-Gutierrez,M., Merino,E.. Antisense-acting riboswitches: A poorly characterized yet important model of transcriptional regulation in prokaryotic organisms.
PLoS ONE,
18 (2),
e0281744.
Preprint
145 - Chowdhury,S., Martinez-Ortiz,I.C., Pando-Robles,V., Moreno,S., Espin,G., Merino,E., Nunez,C.. The Azotobacter vinelandii AlgU Regulon During Vegetative Growth and Encysting Conditions: A Proteomic Approach.
bioRxiv,
Preprint posted May 17.
Artículo
146 - Loza,A., Garcia-Guevara,F., Segovia,L., Escobar-Zepeda,A., Sanchez-Olmos,M.D.C., Merino,E., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L., Juarez,K., Gutierrez-Rios,R.M.. Definition of the Metagenomic Profile of Ocean Water Samples From the Gulf of Mexico Based on Comparison With Reference Samples From Sites Worldwide.
Frontiers in Microbiology,
12,
781497.
Artículo
147 - Angel-Lerma,L.E., Merino,E., Kwon,O., Medina-Aparicio,L., Hernandez-Lucas,I., Alvarez,A.F., Georgellis,D.. Protein dosage of the lldPRD operon is correlated with RNase E-dependent mRNA processing.
Journal of Bacteriology,
203 (6),
e00555-20.
Artículo
148 - Chavez,J., Devos,D.P., Merino,E.. Complementary tendencies in the use of regulatory elements (transcription factors, sigma factors, and riboswitches) in Bacteria and Archaea.
Journal of Bacteriology,
203 (2),
e00413-20.
Artículo
149 - Tenorio-Salgado,S., Castelan-Sanchez,H.G., Davila-Ramos,S., Huerta-Saquero,A., Rodriguez-Morales,S., Merino-Perez,E., Roa de la Fuente LF, Solis-Pereira,S.E., Perez-Rueda,E., Lizama-Uc,G.. Metagenomic analysis and antimicrobial activity of two fermented milk kefir samples.
Microbiologyopen,
10 (2),
e1183.
Libro nacional
Artículo
151 - Raggi,L., Garcia-Guevara,F, Godoy-Lozano,E.E., Martinez-Santana,A., Escobar-Zepeda,A., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Merino,E., Sanchez-Flores,A., Licea-Navarro,A., Pardo-Lopez,L., Segovia,L., Juarez,K.. Metagenomic Profiling and Microbial Metabolic Potential of Perdido Fold Belt (NW) and Campeche Knolls (SE) in the Gulf of Mexico.
Frontiers in Microbiology,
11.
Nacional
152 - Morales,N., Merino,E.. Riboswitches: sensores e interruptores bacterianos.
BioTecnologia. Sociedad Mexicana de Biotecnologia y Bioingenieria,
24 (2),
8-28.
Artículo
153 - Martinez-Amador,P., Castaneda,N., Loza,A., Soto,L., Merino,E., Gutierrez-Rios,R.M.. Prediction of protein architectures involved in the signaling-pathway initiating sporulation in Firmicutes.
BMC Research Notes,
12 (1),
686,
686.
Artículo
154 - Soto-Aceves,M.P., Cocotl-Yanez,M., Merino,E., Castillo-Juarez,I., Cortes-Lopez,H., Gonzalez-Pedrajo,B., Diaz-Guerrero,M., Servin-Gonzalez,L., Soberon-Chavez,G.. Inactivation of the quorum-sensing transcriptional regulators LasR or RhlR does not suppress the expression of virulence factors and the virulence of Pseudomonas aeruginosa PAO1.
Microbiology,
165 (4),
425-432.
Artículo
155 - Escobar-Zepeda, A., Godoy-Lozano, E.E., Raggi, L., Segovia, L., Merino, E., Gutierrez-Rios, R.M., Juarez, K., Licea-Navarro, A.F., Pardo-Lopez, L., Sanchez-Flores, A.. Analysis of sequencing strategies and tools for taxonomic annotation: Defining standards for progressive metagenomics.
Scientific Reports,
8 (1),
12034.
Artículo
156 - Godoy-Lozano,E.E., Escobar-Zepeda,A., Raggi,L., Merino,E., Gutierrez-Rios,R.M., Juarez,K., Segovia,L., Licea-Navarro,A.F., Gracia,A., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L.. Bacterial diversity and the geochemical landscape in the southwestern Gulf of Mexico.
Frontiers in Microbiology,
9 (OCT),
2528.
Artículo
157 - Taboada, B., Estrada, K., Ciria, R., Merino, E.. Operon-mapper: A Web Server for Precise Operon Identification in Bacterial and Archaeal Genomes.
Bioinformatics,
34 (23),
4118?4120.
Artículo
158 - Gutierrez-Preciado, A., Vargas-Chavez, C., Reyes-Prieto, M., Ordonez, O.F., Santos-Garcia, D., Rosas-Perez, T., Valdivia-Anistro, J., Rebollar, E.A., Saralegui, A., Moya, A., Merino, E., Farias, M.E., Latorre, A., Souza, V.. The genomic sequence of Exiguobacterium chiriqhucha str. N139 reveals a species that thrives in cold waters and extreme environmental conditions.
PeerJ,
5,
e3162.
Revisión
159 - Merino, E., Flores-Encarnacion, M., Aguilar-Gutierrez, G.R.. Functional interaction and structural characteristics of unique components of Helicobacter pylori T4SS.
Febs Journal,
284 (21),
3540-3549.
Artículo
160 - Pannier, L., Merino, E., Marchal, K., Collado-Vides, J.. Effect of genomic distance on coexpression of coregulated genes in E. coli.
PLoS ONE,
12 (4),
e0174887.
Artículo
161 - Rodriguez-Mejia, J.L., Roldan-Salgado, A., Osuna, J., Merino, E., Gaytan, P.. A Codon Deletion at the Beginning of Green Fluorescent Protein Genes Enhances Protein Expression.
Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology,
27 (1),
1-10.
Artículo
162 - Vega-Cabrera, L.A., Guerrero, A., Rodriguez-Mejia, J.L., Tabche, M.L., Wood, C.D., Gutierrez-Rios, R.M., Merino, E., Pardo-Lopez, L.. Analysis of Spo0M function in Bacillus subtilis.
PLoS ONE,
12 (2),
e0172737.
Artículo
163 - Zappulo, A., van den, Bruck D., Ciolli, Mattioli C., Franke, V., Imami, K., McShane, E., Moreno-Estelles, M., Calviello, L., Filipchyk, A., Peguero-Sanchez, E., Muller, T., Woehler, A., Birchmeier, C., Merino, E., Rajewsky, N., Ohler, U., Mazzoni, E.O., Selbach, M., Akalin, A., Chekulaeva, M.. RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome.
Nature Communications,
8 (1),
583.
Artículo
164 - Mucito-Varela,E., Castillo-Rojas,G., Cevallos,M.A., Lozano,L., Merino,E., Lopez-Leal,G., Lopez-Vidal,Y.. Complete Genome Sequence of Helicobacter pylori Strain 7C Isolated from a Mexican Patient with Chronic Gastritis.
Genome Announcements,
4 (1).
Artículo
165 - Oliver,P., Peralta-Gil,M., Tabche,M.L., Merino,E.. Molecular and structural considerations of TF-DNA binding for the generation of biologically meaningful and accurate phylogenetic footprinting analysis: the LysR-type transcriptional regulator family as a study model.
BMC Genomics,
17,
686.
Artículo
166 - Rodriguez-Escamilla,Z., Martinez-Nunez,M.A., Merino,E.. Epigenetics knocks on synthetic biology's Door.
Fems Microbiology Letters,
363 (17),
fnw191.
Divulgación
167 - Peguero-Sanchez,E., Pardo-Lopez,L., Merino-Perez,E.. Descifrando el lenguaje de la vida.
Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM,
4,
3-4.
Artículo
168 - Gutierrez-Preciado,A., Torres,A.G., Merino,E., Bonomi,H.R., Goldbaum,F.A., Garcia-Angulo,V.A.. Extensive Identification of Bacterial Riboflavin Transporters and Their Distribution across Bacterial Species.
PLoS ONE,
10 (5),
e0126124.
Artículo
169 - Moran,J., Ramirez,G., Jimenez,L., Cruz,A., Perez-Patrigeon,S., Hidalgo,A., Orozco,L., Martinez,A., Padilla,L., Avila-Moreno,F., Cabello,C., Granados,J., Ortiz-Quintero,B., Ramirez-Venegas,A., Ruiz-Palacios,G.M., Zlotnik,A., Merino,E., Zuniga,J.. Circulating levels of miR-150 are associated with poorer outcomes of A/H1N1 infection.
Experimental and Molecular Pathology,
99 (2),
253-261.
Artículo
170 - Peguero-Sanchez,E., Pardo-Lopez,L., Merino,E.. IRES-dependent translated genes in fungi: computational prediction, phylogenetic conservation and functional association.
BMC Genomics,
16 (1),
1059.
Artículo
171 - Grosso-Becerra,M.V., Croda-Garcia,G., Merino,E., Servin-Gonzalez,L., Mojica-Espinosa,R., Soberon-Chavez,G.. Regulation of Pseudomonas aeruginosa virulence factors by two novel RNA thermometers.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,
111 (43),
15562-15567.
Artículo
172 - Barraza,A., Estrada-Navarrete,G., Rodriguez-Alegria,M.E., Lopez-Munguia,A., Merino,E., Quinto,C., Sanchez,F.. Down-regulation of PvTRE1 enhances nodule biomass and bacteroid number in the common bean.
New Phytologist,
197 (1),
194-206.
Artículo
173 - Freyre-Gonzalez,J.A., Manjarrez-Casas,A.M., Merino,E., Martinez-Nunez,M., Perez-Rueda,E., Gutierrez-Rios,R.M.. Lessons from the modular organization of the transcriptional regulatory network of Bacillus subtilis.
BMC Systems Biology,
7 (1),
127.
Internacional
174 - Merino,E., Jensen,R.A., Yanofsky,C.. trp Operon Organization and Regulation in Different Bacterial Species. Brenner's Encyclopedia of Genetics (Second Edition).
208-212,
San Diego.
Divulgacion nacional
175 - Burlak,G., Martinez-Guerrero, C.E., Merino-Perez, E.. Mini-BLAST: computer systems to search
for the pattern sequences in the bioinformatics databases.
Programacion Matematica y Software,
5 (2),
1-5.
Artículo
176 - Gutierrez-Preciado,A., Merino,E.. Elucidating metabolic pathways and digging for genes of unknown function in microbial communities: the riboswitch approach.
Clinical Microbiology and Infection,
18 Suppl 4,
35-39.
Artículo
177 - Taboada,B., Ciria,R., Martinez-Guerrero,C.E., Merino,E.. ProOpDB: Prokaryotic Operon DataBase.
Nucleic Acids Research,
40 (1),
D627-D631.
Revisión
178 - Martinez-Nunez,M.A., Perez-Rueda,E., Gutierrez-Rios,R.M., Merino,E.. New insights into the regulatory networks of paralogous genes.
Microbiology,
156 (1),
14-22.
Artículo
179 - Taboada,B., Verde,C., Merino,E.. High accuracy operon prediction method based on STRING database scores.
Nucleic Acids Research,
3812 (E130).
Artículo
180 - De la Cruz,M.A., Merino,E., Oropeza,R., Tellez,J., Calva,E.. The DNA static curvature has a role in the regulation of the ompS1 porin gene in Salmonella enterica serovar Typhi.
Microbiology,
155 (7),
2127-2136.
Revisión
181 - Gutierrez-Preciado,A., Henkin,T.M., Grundy,F.J., Yanofsky,C., Merino,E.. Biochemical Features and Functional Implications of the RNA-Based T-Box Regulatory Mechanism.
Microbiology and Molecular Biology Reviews,
73 (1),
36-61.
Artículo
182 - Qu,Y., Brown,P., Barbe,J.F., Puljic,M., Merino,E., Adkins,R.M., Lovley,D.R., Krushkal,J.. GSEL version 2, an online genome-wide query system of operon organization and regulatory sequence elements of Geobacter sulfurreducens.
OMICS,
13 (5),
439-449.
Artículo
183 - Romero-Garcia,S., Hernandez-Bustos,C., Merino,E., Gosset,G., Martinez,A.. Homolactic fermentation from glucose and cellobiose using Bacillus subtilis.
Microbial Cell Factories,
8 (1),
23.
Memoria in extenso
184 - Ciuffo,L.N., Alves,L., Alves de Melo,A.C., Aparicio,G., Arce,P., Blanquer,I., Burbano,D.A., Carrion,A., Castro,H., Hernandez,V., Hurtado,J.M., Isea,R., Lagares,J.I., Lopez-Fenner,J., Mayo,R., Merino,E., Montes,E., Nogales-Cadenas,I., Oliviera,I., Pascual-Montano,A., Perez,M.A., Pezoa,R., Roa,J.C., Romero,F., Rubio-Montero,J.A., Salinas,L., Tirado,F., Verleyen,J., Vicente-Molina,C., Walter,W.E.. Biomedical applications in the EELA-2 project. NETTAB 2009 Ninth Annual Workshop Network Tools and Applications in Biology, 10-12 June 2009, Catania, Italy.
Liberodescrivere,
35-38.
Internacional
185 - Gutierrez-Preciado,A., Peimbert,M., Merino,E.. Genome Sequence Databases: Types of Data and Bioinformatic Tools. Encyclopedia of Microbiology.
211-236,
3a,
Oxford.
Memoria in extenso
186 - Verleyen,J., Hurtado-Ramirez,J.M., Merino-Perez,E.. Meta-Dock, a gridification of a docking application. Proceedings of the First EELA-2.
147-153.
Artículo
187 - Arreola,R., Vega-Miranda,A., Gomez-Puyou,A., Perez-Montfort,R., Merino-Perez,E., Torres-Larios,A.. Expression, purification and preliminary X-ray diffraction studies of the transcriptional factor PyrR from Bacillus halodurans.
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications,
64 (Pt 8),
692-696.
Artículo
188 - FLORES,N., Escalante,A., de Anda,R., Baez-Viveros,J.L., Merino,E., Franco,B., Georgellis,D., Gosset,G., Bolivar,F.. New Insights into the Role of Sigma Factor RpoS as Revealed in Escherichia coli Strains Lacking the Phosphoenolpyruvate:Carbohydrate Phosphotransferase System.
Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology,
14 (4),
176-192.
Artículo
189 - Gama-Castro,S., Jimenez-Jacinto,V., Peralta-Gil,M., Santos-Zavaleta,A., Penaloza-Spinola,M.I., Contreras-Moreira,B., Segura-Salazar,J., Muniz-Rascado,L., Martinez-Flores,I., Salgado,H., Bonavides-Martinez,C., Abreu-Goodger,C., Rodriguez-Penagos,C., Miranda-Rios,J., Morett,E., Merino,E., Huerta,A.M., Trevino-Quintanilla,L., Collado-Vides,J.. RegulonDB (version 6.0): gene regulation model of Escherichia coli K-12 beyond transcription, active (experimental) annotated promoters and Textpresso navigation.
Nucleic Acids Research,
36 (Database issue),
D120-D124.
Artículo
190 - Martinez-Guerrero,C.E., Ciria,R., Abreu-Goodger,C., Moreno-Hagelsieb,G., Merino,E.. GeConT 2: gene context analysis for orthologous proteins, conserved domains and metabolic pathways.
Nucleic Acids Research,
36 (Web Server issue) ((Web Server issue)),
W176-W180.
Revisión
191 - Merino,E., Jensen,R.A., Yanofsky,C.. Evolution of bacterial trp operons and their regulation.
Current Opinion in Microbiology,
11 (2),
78-86.
Artículo
192 - Rodriguez-Magadan,H., Merino,E., Schnabel,D., Ramirez,L., Lomeli,H.. Spatial and temporal expression of Zimp7 and Zimp10 PIAS-like proteins in the developing mouse embryo.
Gene Expression Patterns,
8 (3),
206-213.
Nacional
193 - Gutierrez,R.M., Merino,E.. Genes, genomas y metagenomas: de Mendel a Venter. Una ventana al quehacer científico. Instituto de Biotecnología de la UNAM 25 aniversario, cap 7.
70-80,
Mexico, D.F..
Artículo
194 - Gutierrez-Preciado,A., Yanofsky,C., Merino,E.. Comparison of tryptophan biosynthetic operon regulation in different Gram-positive bacterial species.
Trends in Genetics,
23 (9),
422-426.
Artículo
195 - Romero,S., Merino,E., Bolivar,F., Gosset,G., Martinez,A.. Metabolic engineering of Bacillus subtilis for ethanol production: Lactate dehydrogenase plays a key role in the fermentative metabolism.
Applied and Environmental Microbiology,
73 (16),
5190-5198.
Artículo; Actas Paper
196 - Abreu-Goodger,C., Merino,E.. Identification of bacteria riboswitches through comparative genomics.
Revista Latinoamericana de Microbiologia,
48 (2),
143-145.
Artículo
Artículo
198 - Abreu-Goodger,C., Merino,E.. RibEx: a web server for locating riboswitches and other conserved bacterial regulatory elements.
Nucleic Acids Research,
33 (Web Server Issue),
W690-W692.
Artículo
199 - Gutierrez-Preciado,A., Jensen,R.A., Yanofsky,C., Merino,E.. New insights into regulation of the tryptophan biosynthetic operon in Gram-positive bacteria.
Trends in Genetics,
21 (8),
432-436.
Artículo
200 - Merino,E., Yanofsky,C.. Transcription attenuation: a highly conserved regulatory strategy used by bacteria.
Trends in Genetics,
21 (5),
260-264.
Artículo
201 - Abreu-Goodger,C., Ontiveros-Palacios,N., Ciria,R., Merino,E.. Conserved regulatory motifs in bacteria: riboswitches and beyond.
Trends in Genetics,
20 (10),
475-479.
Artículo
202 - Ciria,R., Abreu-Goodger,C., Morett,E., Merino,E.. GeConT: gene context analysis.
Bioinformatics,
20 (14),
2307-2308.
Nacional
203 - Merino,E.. Las matematicas en la genomica molecular. Las matematicas y su entorno.
67-88,
Mexico.
Artículo
204 - Corona,M., Coronas,F.V., Merino,E., Becerril,B., Gutierrez,R., Rebolledo-Antunez,S., Garcia,D.E., Possani,L.D.. A novel class of peptide found in scorpion venom with neurodepressant effects in peripheral and central nervous system of the rat.
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins & Proteomics,
1649 (1),
58-67.
Artículo
205 - Jauregui,R., Abreu-Goodger,C., Moreno-Hagelsieb,G., Collado-Vides,J., Merino,E.. Conservation of DNA curvature signals in regulatory regions of prokaryotic genes.
Nucleic Acids Research,
31 (23),
6770-6777.
Internacional
206 - Devos,D, Merino,E., Pazos,F, Valencia,A.. Multiple Sequence Alignment Information in Structure and Function Prediction. Artificial intelligence and heuristic methods in bioinformatics.
NATO Science Series. Series III, Computer and systems sciences, 1387-6694 ; v. 183,
83-94,
Amsterdam.
Internacional
207 - Morett,E., Saab-Rincon,G., Merino,E., Bork,P., Rajan,E., Olvera,L., Olvera,M.. High rate of gene displacement in vitamin biosynthesis pathways. Bioinformatics and genomes: current perspectives.
69-79,
Norfolk,U.K..
Divulgación
208 - Merino,E.. Analisis de secuencias en la era genomica.
Revista de la Universidad Nacional Autónoma de M?xico,
629,
15-23.
Divulgación
209 - Merino,E.. Análisis de secuencias en la era genómica. Una mirada hacia el pasado.
Revista Universidad de Mexico,
629.
Editorial Material
210 - Rodriguez de la Vega,R.C., Merino,E., Becerril,B., Possani,L.D.. Novel interactions between K(+) channels and scorpion toxins.
Trends in Pharmacological Sciences,
24 (5),
222-227.
Artículo
211 - Corona,M., Gurrola,G.B., Merino,E., Cassulini,R.R., Valdez-Cruz,N.A., Garcia,B, Ramirez-Dominguez,M.E., Coronas,F.I., Zamudio,F.Z., Wanke,E., Possani,L.D.. A large number of novel Ergtoxin-like genes and ERG K(+)-channels blocking peptides from scorpions of the genus Centruroides.
FEBS Letters,
532 (1-2),
121-126.
Internacional
212 - Merino,E., Yanofsky,C.. Regulation by termination-antitermination: a genomic approach. Bacillus subtilis and Its Closest Relatives: from Genes to Cells .
323-326,
Washington.
Internacional
213 - Possani,L.D., Merino,E., Corona,M., Becerril,B.. Scorpion genes and peptides specific for potassium channels: Structure, function and evolution. Perspectives in Molecular Toxinology.
201-214.
Artículo
214 - Corona,M., Valdez-Cruz,N.A., Merino,E., Zurita,M., Possani,L.D.. Genes and peptides from the scorpion Centruroides sculpturatus Ewing, that recognize Na(+)-channels.
Toxicon,
39 (12),
1893-1898.
Artículo
215 - Jan,J., Valle,F., Bolivar,F., Merino,E.. Construction of protein overproducer strains in Bacillus subtilis by an integrative approach.
Applied Microbiology and Biotechnology,
55 (1),
69-75.
Internacional
216 - Babitsky,P, Gollnick,P, Merino,E., Yanofsky,C.. Aromatic amino acid metabolism in Bacillus Subtilis. Bacillus subtilis and its closest relatives: from genes to cells.
233-244,
New York.
Artículo
217 - Jan,J., Valle,F., Bolivar,F., Merino,E.. Characterization of the 5 ' subtilisin (aprE) regulatory region from Bacillus subtilis.
Fems Microbiology Letters,
183 (1),
9-14.
Artículo
218 - Jauregui,R., Bolivar,F., Merino,E.. Relationship between whole proteome aminoacid composition and static DNA curvature.
Microbial & comparative genomics,
5 (1),
7-15.
Artículo
219 - Merino,E., Garciarrubio,A.. The global intrinsic curvature of archaeal and eubacterial genomes is mostly contained in their dinucleotide composition and is probably not an adaptation.
Nucleic Acids Research,
28 (12),
2431-2438.
Artículo
220 - Possani,L.D., Merino,E., Corona,M., Bolivar,F., Becerril,B.. Peptides and genes coding for scorpion toxins that affect ion-channels.
Biochimie,
82 (9-10),
861-868.
Artículo
221 - Sarsero,J.P., Merino,E., Yanofsky,C.. A Bacillus subtilis gene of previously unknown function, yhaG, is translationally regulated by tryptophan-activated TRAP and appears to be involved in tryptophan transport.
Journal of Bacteriology,
182 (8),
2329-2331.
Artículo
222 - Sarsero,J.P., Merino,E., Yanofsky,C.. A Bacillus subtilis operon containing genes of unknown function senses tRNATrp charging and regulates expression of the genes of tryptophan biosynthesis.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,
97 (6),
2656-2661.
Artículo
223 - Jauregui,R., O'Reilly,F., Bolivar,F., Merino,E.. Relationship between codon usage and sequence-dependent curvature of genomes.
Microbial & comparative genomics,
3 (4),
243-253.
Artículo
224 - Sanchez-Lopez,R., Gama-Castro,S., Ramos,M.A., Merino,E., Lizardi,P.M., Alagon,A.. Cloning and expression of the Entamoeba histolytica ERD2 gene.
Molecular and Biochemical Parasitology,
92 (2),
355-359.
Artículo
225 - Merino,E., Babitzke,P., Yanofsky,C.. trp RNA-binding attenuation protein (TRAP)-trp leader RNA interactions mediate translational as well as transcriptional regulation of the Bacillus subtilis trp operon.
Journal of Bacteriology,
177 (22),
6362-6370.
*
Artículo
226 - Ospina,S., Merino,E., Ramirez,O.T., Lopez-Munguia,A.. Recombinant whole cell penicillin acylase biocatalyst: Production, characterization and use in the synthesis and hydrolysis of antibiotics.
Biotechnology Letters,
17 (6),
615-620.
Artículo
227 - Merino,E., Balbas,P., Puente,J.L., Bolivar,F.. Antisense overlapping open reading frames in genes from bacteria to humans.
Nucleic Acids Research,
22 (10),
1903-1908.
Artículo
228 - Ramirez,O.T., Zamora,R., Espinosa,G., Merino,E., Bolivar,F., Quintero,R.. Kinetic study of penicillin acylase production by recombinant E. Coli in batch cultures.
Process Biochemistry,
29 (3),
197-206.
Artículo
229 - FLORES,N., Valle,F., Bolivar,F., Merino,E.. Recovery of DNA from agarose gels stained with methylene blue.
Biotechniques,
13 (2),
203-205.
Artículo
230 - Merino,E., Osuna,J., Bolivar,F., Soberon,X.. A general, PCR-based method for single or combinatorial oligonucleotide-directed mutagenesis on pUC/M13 vectors.
Biotechniques,
12 (4),
508-510.
Artículo
231 - Merino,E., Balbas,P., Aarons,S.R., Recillas,F., Becerril,B., Valle,F., Bolivar,F.. Carbon regulation and the role in nature of the Escherichia coli penicillin acylase (pac) gene.
Molecular Microbiology,
6 (15),
2175-2182.
232 - Merino Perez, Enrique. Caracterizacion, manipulacion y posible papel en la naturaleza del gene pac y su producto, la enzima penicilino acilasa del Escherichia coli .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Biotecnologia,
UNAM.
Asesor: Bolivar Zapata, Francisco
Artículo
233 - Merino,E., Balbas,P., Bolivar,F.. New insights on the comma-less theory.
Origins of Life and Evolution of the Biosphere,
21 (4),
251-254.
Revisión
234 - Valle,F., Balbas,P., Merino,E., Bolivar,F.. The role of penicillin amidases in nature and in industry.
Trends in Biochemical Sciences,
16 (1),
36-40.
Artículo
235 - Gosset,G., Merino,E., Recillas,F., Oliver,G., Becerril,B., Bolivar,F.. Amino acid sequence analysis of the glutamate synthase enzyme from Escherichia coli K-12.
Protein sequences & data analysis,
2 (1),
9-16.
Note
236 - Merino,E., Bolivar,F.. The ribonucleoside diphosphate reductase gene (nrdA) of Escherichia coli carries a repetitive extragenic palindromic (REP) sequence in its 3' structural terminus.
Molecular Microbiology,
3 (6),
839-841.
237 - Merino Perez, Enrique. Estudio de las secuencias palindromicas repetidas extragenicas (REP) en el genoma procarionte .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Investigacion Biomedica Basica,
UNAM.
Asesor: Bolivar Zapata, Francisco
Artículo
239 - Balbas,P., Soberon,X., Merino,E., Zurita,M., Lomeli,H., Valle,F., FLORES,N., Bolivar,F.. Plasmid vector pBR322 and its special-purpose derivatives--a review.
Gene,
50 (1-3),
3-40.
Artículo
240 - Becerril,B., Valle,F., Merino,E., Riba,L., Bolivar,F.. Repetitive extragenic palindromic (REP) sequences in the Escherichia coli gdhA gene.
Gene,
37 (1-3),
53-62.
- Teléfonos
-
Laboratorio +52 (777) 329-1634
desde la CDMX 562-27634
Red UNAM 27634 -
Laboratorio +52 (777) 329-1629
desde la CDMX 562-27629
Red UNAM 27629