La virulencia de muchas bacterias patógenas de humanos, plantas y otros animales depende del sistema de secreción tipo III (SST3), una nanomaquinaria que permite a las bacterias translocar o inyectar proteínas de virulencia al interior de las células eucariontes hospederas. El SST3 es un dispositivo sumamente complejo, cuya estructura está compuesta por más de quince proteínas diferentes, incluyendo proteínas citosólicas, de membrana y extracelulares que se ensamblan con una estequiometría precisa para dar lugar a una de las maquinarias bacterianas más sofisticadas conocidas. En esta charla se discutirá cómo nuestro grupo de investigación está estudiando la relación estructura-función de este sistema de virulencia, así como los nuevos enfoques que estamos desarrollando para entender los mecanismos que determinan su ensamblaje y actividad.
Las tecnologías de célula única (scRNA-seq, ATAC-seq, proteómica y genómica espacial) han transformado nuestra capacidad de resolver la heterogeneidad celular que los métodos “bulk” tradicionalmente promediaban y ocultaban. Esta plática ofrece un panorama de las oportunidades y retos de este cambio de resolución. Entre las oportunidades, se discuten la identificación de subpoblaciones celulares raras, el estudio de la heterogeneidad tumoral y el microambiente inmune, la reconstrucción de trayectorias de diferenciación mediante inferencia de redes regulatorias, y la emergencia de la multi-ómica de célula única, que permite modelos mecanísticos más completos de la función celular. También se abordan avances recientes en transcriptómica espacial y técnicas de alto rendimiento que están escalando el análisis a millones de células. Entre los retos, destacan la integración de datos multimodales y multi-lote, la escalabilidad computacional, la falta de estandarización en pipelines de análisis, y las limitaciones estadísticas al inferir redes regulatorias a partir de datos dispersos. Se discute el papel emergente de modelos de inteligencia artificial entrenados sobre atlas celulares, junto con sus implicaciones para la medicina de precisión en México.
Biotecnología: Organismos transgénicos, sus grandes beneficios y la ausencia de daño
Dr. Francisco G. Bolívar Zapata.
Aula Mayor de El Colegio Nacional.
Ciudad de México, viernes 23 de agosto de 2019