Dra. Rosa Maria Gutierrez Rios
Investigadora Titular B Tiempo Completo

Bioinformática aplicada a las ciencias ómicas
Genómica funcional y evolutiva
Número de registros: 9
  • Activos
  • Vencidos
  • Definición de líneas base metagenómicas para la inferencia de capacidades metabólicas, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2024 - 2026
  • Explorando las capacidades metabólicas de microorganismos marinos identificados en muestras ambientales., CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2022 - 2024
  • Inferencia y comparación de perfiles funcionales metagenómicos de muestras de agua y sedimento marino., DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2021 - 2023
  • Estudio de la diversidad y conservación de las proteínas involucradas en la cascada de esporulación en firmicutes: caracterización funcional de la arquitectura alternativa de la proteína spo0b de oceanobacillus iheyensis como modelo de estudio, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2018 - 2021
  • Procesamiento de información y toma de decisiones en el sistema de esporulación de bacillus subtilis. construcción de un modelo teórico y su caracterización experimental, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2015 - 2018
  • Papel de los factores de transcripción intermodulares en la organización topológica de la red de regulación de bacillus subtilis, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2012 - 2015
  • Estudio comparativo de la red de regulación transcripcional de bacillus subtilis, como producto de su análisis en distintas condiciones experimentales, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2012 - 2014
  • Generación de modelos de regulación de la transcripción en bacillus subtilis y escherichia coli, análisis comparativo y su corroboración experimental, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2008 - 2010
  • Generación, análisis comparativo y verificación experimental de modelos de regulación transcripcional de las redes de escherichia coli y bacillus subtilis, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2007 - 2010

Nivel D del PRIDE
Nivel II del SNII
  • Doctorado
  • Maestría
  • Estancia Temporal
2 - Soto Avila,L. (2020). Estudio de la conservación de las proteínas implicadas en el compromiso para esporular y su distribución en bacterias. Instituto de Investigionen Ciencias Basicas y Aplicadas. Centro de Investigacion en Dinamica Celular, Doctorado en Ciencias, UAEM . *
Total de publicaciones: 55
  • Tipo
  • Fecha
Open Access Artículo
11 - Loza,A., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., Zarate,S., Lopez,S., Ciria,R., Palomares,D., Garcia-Lopez,R., Isa,P., Taboada,B., Rosales,M., Boukadida,C., Herrera-Estrella,A., Mojica,N.S., Rivera-Gutierrez,X., Munoz-Medina,J.E., Salas-Lais,A.G., Sanchez-Flores,A., Vazquez-Perez,J.A., Arias,C.F., Gutierrez-Rios,R.M. (2023). Two-year follow-up of the COVID-19 pandemic in Mexico. Frontiers in Public Health, 10, 1050673.
Open Access Artículo
13 - Zarate,S., Taboada,B., Rosales-Rivera,M., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Gomez-Gil,B., Selem-Mojica N., Salas-Lais,A.G., Vazquez-Perez,J.A., Cabrera-Gaytan,D.A., Fernandes-Matano,L., Uribe-Noguez,L.A., Chale-Dzul,J.B., Maldonado Meza,B.I., Mejia-Nepomuceno,F., Perez-Padilla,R., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A, Roche,B, Lopez,S, Arias,C.F (2023). Omicron-BA.1 Dispersion Rates in Mexico Varied According to the Regional Epidemic Patterns and the Diversity of Local Delta Subvariants. Viruses, 15 (1), 243.
Open Access Artículo
16 - Taboada,B., Zarate,S., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Boukadida,C., Gomez-Gil,B., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Salas-Lais,A.G., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Rivera-Gutierrez,X., Vazquez-Perez,J.A., Avila-Rios,S., Hurtado,J.M., Herrera-Najera,C.I., Nunez-Contreras,J.J., Sarquiz-Martinez,B, Garcia-Arias,V.E., Santiago-Mauricio,M.G., Martinez-Miguel,B., Enciso-Ibarra,J., Chaidez-Quiroz,C., Isa,P., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., Lopez,S., Arias,C.F. (2022). Dominance of Three Sublineages of the SARS-CoV-2 Delta Variant in Mexico. Viruses, 14 (6), 1165.
Open Access Artículo
17 - Zarate,S., Taboada,B., Munoz-Medina,J.E., Isa,P., Sanchez-Flores,A., Boukadida,C., Herrera-Estrella,A., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Gomez-Gil,B., Salas-Lais,A.G., Santacruz-Tinoco,C.E., Montoya-Fuentes,H., ALvarado-Yaah,J.E., Molina-Salinas,G.M., Espinoza-Ayala,G.E., Enciso-Moreno,J.A., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Moreno-Contreras,J., Garcia-Lopez,R., Rivera-Gutierrez,X., Comas-Garcia,A., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., del Angel,R.M., Vazquez-Perez,J.A., Matias-Florentino,M., Perez-Garcia,M., Avila-Rios,S., Castelan-Sanchez,H.G., Delaye,L., Martinez-Castilla,L.P., Escalera-Zamudio,M., Lopez,S., Arias,C.F. (2022). The Alpha Variant (B.1.1.7) of SARS-CoV-2 Failed to Become Dominant in Mexico. Microbiology Spectrum, 10 (2), e0224021.
Artículo
18 - Curiel-Maciel,N.F., Martinez-Morales,F., Licea-Navarro,A.F., Bertrand,B., Aguilar-Guadarrama,A.B., Rosas-Galvan,N.S., Morales-Guzman,D., Rivera-Gomez,N., Gutierrez-Rios,R.M., Trejo-Hernandez,M. (2021). Characterization of Enterobacter cloacae BAGM01 Producing a Thermostable and Alkaline-Tolerant Rhamnolipid Biosurfactant from the Gulf of Mexico. Marine Biotechnology, 23, 106.
Open Access Artículo
22 - Salgado-Camargo,A.D., Castro-Jaimes,S., Gutierrez-Rios,R.M., Lozano,L.F., Altamirano-Pacheco,L., Silva-Sanchez,J., Perez-Oseguera,A., Volkow,P., Castillo-Ramirez,S., Cevallos,M.A. (2020). Structure and Evolution of Acinetobacter baumannii Plasmids. Frontiers in Microbiology, 11, 1283.
Artículo
24 - Chavez, J. C., Vicens, A., Wrighton, D. C., Andrade-Lopez, K., Beltran, C., Gutierrez, R. M., Lippiat, J. D., Trevino, C. L. (2019). A cytoplasmic Slo3 isoform is expressed in somatic tissues. Molecular Biology Reports, 46 (5), 5561?5567.
Open Access Artículo
29 - Pedraza-Perez, Y., Cuevas-Vede, R.A., Canto-Gomez, A.B., Lopez-Pliego, L., Gutierrez-Rios, R.M., Hernandez-Lucas, I., Rubin-Linares, G., Martinez-Laguna, Y., Lopez-Olguin, J.F., Fuentes-Ramirez, L.E. (2018). BLAST-XYPlot Viewer: A Tool for Performing BLAST in Whole-Genome Sequenced Bacteria/Archaea and Visualize Whole Results Simultaneously. G3: Genes, Genomes, Genetics, 8 (7), 2167-2172.
Open Access Artículo
Artículo
35 - Martinez,M.A., Soto-Del Rio,M.D, Gutierrez,R.M., Greninger,A.L., Contreras,J.F., Lopez,S., Arias,C.F., Isa,P. (2015). DNA microarray for detection of gastrointestinal viruses. Journal of Clinical Microbiology, 53 (1), 136-145.
Artículo
37 - Paulin,L.F., Soto-Del Rio,M.D, Sanchez,I., Hernandez,J., Gutierrez-Rios,R.M., Lopez-Martinez,I., Wong-Chew,R.M., Parissi-Crivelli,A., Isa,P., Lopez,S., Arias,C.F. (2014). PhyloFlu, a DNA microarray to determine the phylogenetic origin of influenza A gene segments and the genomic fingerprint of viral strains. Journal of Clinical Microbiology, 52 (3), 803-813.
Revisión
45 - Cevallos,M.A., Cervantes-Rivera,R., Gutierrez-Rios,R.M. (2008). The repABC plasmid family. Plasmid, 60 (1), 19-37.
Artículo
47 - Resendis-Antonio,O., Freyre-Gonzalez,J.A., Menchaca-Mendez,R., Gutierrez-Rios,R.M., Martinez-Antonio,A., Avila-Sanchez,C., Collado-Vides,J. (2005). Modular analysis of the transcriptional regulatory network of E. coli. Trends in Genetics, 21 (1), 16-20. *
Artículo
48 - Gutierrez-Rios,R.M., Rosenblueth,D.A., Loza,J.A., Huerta,A.M., Glasner,J.D., Blattner,F.R., Collado-Vides,J. (2003). Regulatory network of Escherichia coli: consistency between literature knowledge and microarray profiles. Genome Research, 13 (11), 2435-2443. *
Artículo
50 - Collado-Vides,J., Gutierrez-Rios,R.M., Bel-Enguix,G. (1998). Networks of transcriptional regulation encoded in a grammatical model. Biosystems, 47 (1-2), 103-118. *
Open Access Nacional
51 - Herguera,J.C., Scheinbaum,J., Oerez-Brunius,P., Peters,E., Uribe,A., Aguirre-Macedo,L., Vidal-Martinez,V.M., Enriquez,C., Marino-Tapia,I., Garcia-Nava,H., Flores-Vida,X., Salgado,T., Romero-Centeno,R., Zavala,J., Pardo-Lopez,L., Gutierrez-Rios,R.M., Cuevas-Flores,E.A., Carrillo,L., Martinez-Arroyo,M.A., Caso,M., Toro-Valencia,V.G., Carranza,J. (2023). Red de Monitoreo y Predicción de los Océanos para el Desarrollo Sostenible del Golfo de México y el Caribe (ompnetgc). Proyecto ID 37 aprobado por la Década de los Océanos. La Década del Océano en México 2021- 2030 La Ciencia que Necesitamos. 453-456, Campeche: RICOMAR, Universidad Autónoma de Campeche.
Open Access memoria in extenso
52 - Sucar,L.E., Serrano-Perez,J., Gutierrez-Rios,R.M., Pineda,L.A. (2021). Prediction and Analysis of COVID-19 with Probabilistic Graphical Models. Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence. Bayesian Modeling Applications Workshop July 2021. .
Nacional
53 - Gutierrez,R.M., Merino,E. (2008). Genes, genomas y metagenomas: de Mendel a Venter. Una ventana al quehacer científico. Instituto de Biotecnología de la UNAM 25 aniversario, cap 7. 70-80, Mexico, D.F..
Nacional divulgación
55 - Carrera-Reyna,M., Jimenez-Jacinto,V., Gutierrez-Rios,R.M. (2025). Descifrando la información genética. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 10 (40).
Nacional divulgación
56 - Jimenez-Jacinto,V., Carrera-Reyna,M., Ainsworth,S., Gutierrez-Rios,R.M. (2025). Ecos del algoritmo: la evolución de la bioinformática en México. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 10 (40).
Open Access Nacional divulgacion
57 - Carrera-Reyna,M., Gutierrez-Rios,R.M. (2024). Los modernos cazadores de microbios. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 10 (37).
Open Access Nacional divulgación
Open Access Divulgación nacional
60 - Pardo-Lopez,L., Gutierrez-Rios,R.M. (2022). Diversidad bacteriana, una riqueza insospechada. Ciencias y Humanidades, 2 (3 Octubre), 33-37.
Open Access nacional divulgacion
61 - Loza,A., Pineda,L., Dyer-Leal,D.D., Benitez,I., Ciria,R., Cruz,R., Palomares,D., Fianti,Z., Gutierrez-Rios,R.M. (2020). Sistema de información nacional depurado sobre la evolución de la pandemia COVID-19. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 23, 8-11.
Editorial Material
62 - Huerta,A.M., Glasner,J.D., Gutierrez-Rios,R.M., Blattner,F.R., Collado-Vides,J. (2002). GETools: gene expression tool for analysis of transcriptome experiments in E. coli. Trends in Genetics, 18 (4), 217-218. *
Nacional divulgación
64 - Carrera-Reyna,M., Jimenez-Jacinto,V., Gutierrez-Rios,R.M.. Descifrando la información genética. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 10 (40).
Nacional divulgación
65 - Jimenez-Jacinto,V., Carrera-Reyna,M., Ainsworth,S., Gutierrez-Rios,R.M.. Ecos del algoritmo: la evolución de la bioinformática en México. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 10 (40).
Open Access Artículo
Open Access Artículo
Open Access Nacional divulgacion
68 - Carrera-Reyna,M., Gutierrez-Rios,R.M.. Los modernos cazadores de microbios. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 10 (37).
Open Access Artículo
69 - Loza,A., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., Zarate,S., Lopez,S., Ciria,R., Palomares,D., Garcia-Lopez,R., Isa,P., Taboada,B., Rosales,M., Boukadida,C., Herrera-Estrella,A., Mojica,N.S., Rivera-Gutierrez,X., Munoz-Medina,J.E., Salas-Lais,A.G., Sanchez-Flores,A., Vazquez-Perez,J.A., Arias,C.F., Gutierrez-Rios,R.M.. Two-year follow-up of the COVID-19 pandemic in Mexico. Frontiers in Public Health, 10, 1050673.
Open Access Artículo
Open Access Artículo
71 - Zarate,S., Taboada,B., Rosales-Rivera,M., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Gomez-Gil,B., Selem-Mojica N., Salas-Lais,A.G., Vazquez-Perez,J.A., Cabrera-Gaytan,D.A., Fernandes-Matano,L., Uribe-Noguez,L.A., Chale-Dzul,J.B., Maldonado Meza,B.I., Mejia-Nepomuceno,F., Perez-Padilla,R., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A, Roche,B, Lopez,S, Arias,C.F. Omicron-BA.1 Dispersion Rates in Mexico Varied According to the Regional Epidemic Patterns and the Diversity of Local Delta Subvariants. Viruses, 15 (1), 243.
Open Access Nacional
72 - Herguera,J.C., Scheinbaum,J., Oerez-Brunius,P., Peters,E., Uribe,A., Aguirre-Macedo,L., Vidal-Martinez,V.M., Enriquez,C., Marino-Tapia,I., Garcia-Nava,H., Flores-Vida,X., Salgado,T., Romero-Centeno,R., Zavala,J., Pardo-Lopez,L., Gutierrez-Rios,R.M., Cuevas-Flores,E.A., Carrillo,L., Martinez-Arroyo,M.A., Caso,M., Toro-Valencia,V.G., Carranza,J.. Red de Monitoreo y Predicción de los Océanos para el Desarrollo Sostenible del Golfo de México y el Caribe (ompnetgc). Proyecto ID 37 aprobado por la Década de los Océanos. La Década del Océano en México 2021- 2030 La Ciencia que Necesitamos. 453-456, Campeche: RICOMAR, Universidad Autónoma de Campeche.
Preprint
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76 - Taboada,B., Zarate,S., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Boukadida,C., Gomez-Gil,B., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Salas-Lais,A.G., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Rivera-Gutierrez,X., Vazquez-Perez,J.A., Avila-Rios,S., Hurtado,J.M., Herrera-Najera,C.I., Nunez-Contreras,J.J., Sarquiz-Martinez,B, Garcia-Arias,V.E., Santiago-Mauricio,M.G., Martinez-Miguel,B., Enciso-Ibarra,J., Chaidez-Quiroz,C., Isa,P., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., Lopez,S., Arias,C.F.. Dominance of Three Sublineages of the SARS-CoV-2 Delta Variant in Mexico. Viruses, 14 (6), 1165.
Open Access Artículo
77 - Zarate,S., Taboada,B., Munoz-Medina,J.E., Isa,P., Sanchez-Flores,A., Boukadida,C., Herrera-Estrella,A., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Gomez-Gil,B., Salas-Lais,A.G., Santacruz-Tinoco,C.E., Montoya-Fuentes,H., ALvarado-Yaah,J.E., Molina-Salinas,G.M., Espinoza-Ayala,G.E., Enciso-Moreno,J.A., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Moreno-Contreras,J., Garcia-Lopez,R., Rivera-Gutierrez,X., Comas-Garcia,A., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., del Angel,R.M., Vazquez-Perez,J.A., Matias-Florentino,M., Perez-Garcia,M., Avila-Rios,S., Castelan-Sanchez,H.G., Delaye,L., Martinez-Castilla,L.P., Escalera-Zamudio,M., Lopez,S., Arias,C.F.. The Alpha Variant (B.1.1.7) of SARS-CoV-2 Failed to Become Dominant in Mexico. Microbiology Spectrum, 10 (2), e0224021.
Open Access Nacional divulgación
Open Access Divulgación nacional
79 - Pardo-Lopez,L., Gutierrez-Rios,R.M.. Diversidad bacteriana, una riqueza insospechada. Ciencias y Humanidades, 2 (3 Octubre), 33-37.
Artículo
80 - Curiel-Maciel,N.F., Martinez-Morales,F., Licea-Navarro,A.F., Bertrand,B., Aguilar-Guadarrama,A.B., Rosas-Galvan,N.S., Morales-Guzman,D., Rivera-Gomez,N., Gutierrez-Rios,R.M., Trejo-Hernandez,M.. Characterization of Enterobacter cloacae BAGM01 Producing a Thermostable and Alkaline-Tolerant Rhamnolipid Biosurfactant from the Gulf of Mexico. Marine Biotechnology, 23, 106.
Open Access Revisión
Open Access Artículo
Open Access memoria in extenso
83 - Sucar,L.E., Serrano-Perez,J., Gutierrez-Rios,R.M., Pineda,L.A.. Prediction and Analysis of COVID-19 with Probabilistic Graphical Models. Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence. Bayesian Modeling Applications Workshop July 2021. .
Libro nacional
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Open Access Artículo
86 - Salgado-Camargo,A.D., Castro-Jaimes,S., Gutierrez-Rios,R.M., Lozano,L.F., Altamirano-Pacheco,L., Silva-Sanchez,J., Perez-Oseguera,A., Volkow,P., Castillo-Ramirez,S., Cevallos,M.A.. Structure and Evolution of Acinetobacter baumannii Plasmids. Frontiers in Microbiology, 11, 1283.
Open Access nacional divulgacion
87 - Loza,A., Pineda,L., Dyer-Leal,D.D., Benitez,I., Ciria,R., Cruz,R., Palomares,D., Fianti,Z., Gutierrez-Rios,R.M.. Sistema de información nacional depurado sobre la evolución de la pandemia COVID-19. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 23, 8-11.
Artículo
100 - Martinez,M.A., Soto-Del Rio,M.D, Gutierrez,R.M., Greninger,A.L., Contreras,J.F., Lopez,S., Arias,C.F., Isa,P.. DNA microarray for detection of gastrointestinal viruses. Journal of Clinical Microbiology, 53 (1), 136-145.
Revisión
110 - Cevallos,M.A., Cervantes-Rivera,R., Gutierrez-Rios,R.M.. The repABC plasmid family. Plasmid, 60 (1), 19-37.
Nacional
111 - Gutierrez,R.M., Merino,E.. Genes, genomas y metagenomas: de Mendel a Venter. Una ventana al quehacer científico. Instituto de Biotecnología de la UNAM 25 aniversario, cap 7. 70-80, Mexico, D.F..
Artículo
113 - Resendis-Antonio,O., Freyre-Gonzalez,J.A., Menchaca-Mendez,R., Gutierrez-Rios,R.M., Martinez-Antonio,A., Avila-Sanchez,C., Collado-Vides,J.. Modular analysis of the transcriptional regulatory network of E. coli. Trends in Genetics, 21 (1), 16-20. *
Artículo
115 - Gutierrez-Rios,R.M., Rosenblueth,D.A., Loza,J.A., Huerta,A.M., Glasner,J.D., Blattner,F.R., Collado-Vides,J.. Regulatory network of Escherichia coli: consistency between literature knowledge and microarray profiles. Genome Research, 13 (11), 2435-2443. *
Artículo
Editorial Material
117 - Huerta,A.M., Glasner,J.D., Gutierrez-Rios,R.M., Blattner,F.R., Collado-Vides,J.. GETools: gene expression tool for analysis of transcriptome experiments in E. coli. Trends in Genetics, 18 (4), 217-218. *
Artículo
118 - Collado-Vides,J., Gutierrez-Rios,R.M., Bel-Enguix,G.. Networks of transcriptional regulation encoded in a grammatical model. Biosystems, 47 (1-2), 103-118. *