Biología molecular y celular de la infección por virus gastrointestinales
Epidemiología, diagnóstico y metagenómica viral
Genómica funcional de la interacción virus-célula hospedera
Número de registros: 28
  • Activos
  • Vencidos
  • Combining mathematical modeling and phylodynamics analyses to characterize interactions between sars-cov-2 lineages within the increasingly vaccinated population of mexico city, ANRS-EMERGING INFECTIOUS DISEASES, 2022 - 2024
  • Desarrollo de un sistema para evaluar la respuesta inmune temprana y convaleciente de pacientes infectados con sars-cov-2 y de inmunoterápicos para enfermos en estado crítico por covid-19, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2020 - 2023
  • Epidemiología genómica del nuevo coronavirus sars-cov-2 en méxico y desarrollo y validación de un inmunoensayo para caracterizar la respuesta inmune de personas con covid-19, SECRETARIA DE EDUCACIÓN, CIENCIA, TECNOLOGÍA E INNOVACIÓN, 2020 - 2022
  • Structural, mechanistic, and antigenic insights into the human astrovirus capsid, NATIONAL INSTITUTES OF HEALTH, 2019 - 2024
  • Vigilancia genómica del virus sars-cov-2 en méxico-2022 (extensión 2022), CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 1900 - 2022
  • Genomic surveillance of sars-cov-2 variants in mexico, AIDS Healthcare Foundation, 2021 - 2022
  • Vigilancia genómica del virus sars-cov-2 en méxico, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2021
  • Epidemiología genómica de los virus sars-cov-2 circulantes en méxico, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2020 - 2021
  • Desarrollo de los componentes necesarios para implementar métodos diagnósticos para el virus de zika, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2016 - 2017
  • Laboratorio nacional de apoyo tecnológico a las ciencias genómicas, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2015 - 2016
  • Disección del tráfico vesicular utilizado por rotavirus durante su replicación en la célula hospedera, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2014 - 2018
  • Apoyo ante la amenaza del ébola en méxico, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2014 - 2015
  • Laboratorio nacional de respuesta a enfermedades emergentes, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2014
  • Biología celular de la infección por rotavirus, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2014 - 2017
  • Biología molecular de virus y genómica funcional de la interacción virus célula huésped, PRESUPUESTO UNAM, 2014 - 2020
  • Actualización del equipo científico del instituto de biotecnología de la universidad nacional autónoma de méxico, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2010 - 2011
  • Caracterización molecular de los virus asociados a la epidemia de influenza 2009, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2009 - 2010
  • Implementacion y validacion de una metodologia para la deteccion de patogenos asociados a enfermedades respiratorias por medio de un microarreglo, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2009
  • Metagenomics for detection and discovery of viruses associates with acute gastroenteritis, UNIVERSIDAD DE CALIFORNIA-MÉXICO, 2008 - 2009
  • Identificación de genes celulares necesarios para la replicación de rotavirus, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2008 - 2010
  • Influenza: epidemiología molecular y desarrollo de antivirales y métodos diagnósticos novedosos, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2007 - 2010
  • Laboratorio nacional de respuesta a enfermedades emergentes, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2007 - 2010
  • ¿están los microdominios de membrana involucrados en la unión y entrada de los rotavirus a su célula?, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2002 - 2003
  • Grant of the international research scholars program argentina, brazil, canada, chile, mexico and venezuela, 2001., HOWARD HUGHES MEDICAL INSTITUTE, 2002 - 2006
  • Biología molecular de la interacción rotavirus-célula huésped., CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2001 - 2006
  • Biología molecular de la replicación de rotavirus, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 1997 - 2002
  • Molecular biology of rotavirus replication, HOWARD HUGHES MEDICAL INSTITUTE, 1997 - 2001
  • Caracterización de las primeras interacciones rotavirus-célula, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 1996 - 1999

Nivel D del PRIDE
Nivel Investigador Emérito del SNI
  • Doctorado, Investigacion Biomedica Basica, Instituto de Investigaciones Biomedicas (1985)

  • Maestría, Investigacion Biomedica Basica, Instituto de Investigaciones Biomedicas (1981)

  • Licenciatura, Químico Farmaceutico Biologo, Fac. Química, UNAM (1978)

  • Premio Nacional de Ciencias y Artes en el área de Ciencias Físico-Matemáticas y Naturales, 2014

  • Premio Universidad Nacional en el área de Investigación en Ciencias Naturales, UNAM, 2013

  • Premio Bienal Funsalud en Enfermedades Gastrointestinales (NADRO), Fundación Mexicana para la Salud, 2002

  • Howard Hughes Medical Institute International Research Scholar 2002-2006, 2002

  • Premio Carlos J. Finlay de Microbiología, UNESCO, 2001

  • Premio Bienal FUNSALUD en Infecciones Gastrointestinales, Fundación Mexicana para la Salud, 2000

  • Howard Hughes Medical Institute International Research Scholar 1997-2001, 1997

  • Premio de la Academia de la Investigación Científica en el área de Ciencias Naturales, 1993

  • Howard Hughes Medical Institute International Research Scholar 1991-1996, 1991

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7 - Torres Flores, Jesus Miguel (2016). Estudio del papel de las proteinas de uniones estrechas en la infeccion por rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
9 - Martinez Guevara, Jose Luis (2015). Analisis de la funcion del complejo proteico copi en el ciclo de replicacion de rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
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16 - Realpe Quintero, Mauricio Alberto (2010). Caracterizacion de la infectividad de rotavirus en celulas polarizadas MDCKII . Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
17 - Diaz Salinas, Marco Aurelio (2009). Reconstitucion de particulas infecciosas de rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
19 - Perez-Vargas Obregon, Jimena (2006). Caracterizacion del papel de Chaperona de la proteina HSC70 en la infeccion por rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
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21 - Lopez-Guerrero, Delia Vanessa (2004). Evaluacion de replicones de RNA como potenciales vacunas contra rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Biotecnologia, UNAM.
Asesor: Arias Ortiz, Carlos F., Esquivel Guadarrama, Fernando

22 - Dector Carrillo, Miguel Angel (2003). Inhibicion de la expresion de genes especificos de rotavirus mediante RNAs interferentes. Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
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28 - Guerrero Fonseca, Carlos Arturo (2000). Identificacion y caracterizacion de receptores celulares para rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Ciencias Biomedicas, UNAM.
31 - Padilla Noriega, Luis (1994). Diversidad de epitopes de neutralizacion de la proteina VP4 de rotavirus de humano . Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Biotecnologia, UNAM.
32 - Fuentes Panana, Ezequiel Moises (1994). Mapeo del dominio de hemaglutinacion de rotavirus animales . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Biotecnologia, UNAM.
37 - Lizano Soberon, Marcela (1989). Caracterizacion de distintas regiones de la proteina de superficie VP3 del rotavirus SA11, sintetizadas en E. Coli . Centro de Investigacion sobre Ingenieria Genetica y Biotecnologia, Maestria en Investigacion Biomedica Basica, UNAM.
38 - Ruiz Morales, Alberto Ciceron (1988). Caracterizacion antigenica y molecular del rotavirus porcino YM. Posible nuevo serotipo de rotavirus . FES Cuautitlan, Maestria en Microbiologia, UNAM. *
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41 - Garcia Perez, Gabriela (1986). Sintesis y caracterizacion de un oligopeptido que mimetiza una region de la glicoproteina VP7 del rotavirus del simio SA11. Facultad de Ciencias, Licenciatura en Biología, UNAM. *
Total de publicaciones: 243
  • Tipo
  • Fecha
Open Access Artículo
44 - Boukadida,C., Taboada,B., Escalera-Zamudio,M., Isa,P., Ramirez-Gonzalez,J.E., Vazquez-Perez,J.A., Munoz-Medina,J.E., Grajales-Muniz,C., Gonzalez-Torres,C., Gaytan-Cervantes,F.J., Rincon-Rubio,A., Matias-Florentino,M., Paz-Juarez,H.E., Sanchez-Flores,A., Mendieta-Condado,E., Barrera-Badillo,G., Hernandez-Rivas,L., Lopez,S., Lopez-Martinez,I, Avila-Rios,S., Arias,C.F. (2022). Genomic Characterization of SARS-CoV-2 Isolated from Patients with Distinct Disease Outcomes in Mexico. Microbiology Spectrum, 10 (1), e01249-21.
Open Access Artículo
45 - Hernandez-Teran,A., Garciadiego-Fossas,P, Villanueva-Reza,M, Boukadida,C, Taboada,B, Porras,E, Ahumada-Topete,V., Tapia-Diaz,K.E, Matias-Florentino,M., Perez-Garcia,M., Avila-Rios,S., Mejia-Nepomuceno,F, Serna-Munoz,R, Juarez-Hernandez,F., Jimenez-Corona,M.E., Becerril-Vargas,E, Barreto,O, Martinez-Orozco,J.A, Perez-Padilla,R., Arias,C.F, Vazquez-Perez,J.A. (2022). Clinical and Virological Features of Patients Hospitalized with Different Types of COVID-19 Vaccination in Mexico City. Vaccines (Basel), 10 (8).
Open Access Artículo
48 - Moreno-Contreras,J., Espinoza,M.A., Sandoval-Jaime,C., Cantu-Cuevas,M.A., Madrid-Gonzalez,D.A., Baron-Olivares,H., Ortiz-Orozco,O.D., Munoz-Rangel,A.V., Guzman-Rodriguez,C., Hernandez-de la Cruz M., Eroza-Osorio,C.M., Arias,C.F., Lopez,S. (2022). Pooling saliva samples as an excellent option to increase the surveillance for SARS-CoV-2 when re-opening community settings. PLoS ONE, 17 (1), e0263114.
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Open Access Artículo
51 - Taboada,B., Zarate,S., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Boukadida,C., Gomez-Gil,B., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Salas-Lais,A.G., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Rivera-Gutierrez,X., Vazquez-Perez,J.A., Avila-Rios,S., Hurtado,J.M., Herrera-Najera,C.I., Nunez-Contreras,J.J., Sarquiz-Martinez,B, Garcia-Arias,V.E., Santiago-Mauricio,M.G., Martinez-Miguel,B., Enciso-Ibarra,J., Chaidez-Quiroz,C., Isa,P., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., Lopez,S., Arias,C.F. (2022). Dominance of Three Sublineages of the SARS-CoV-2 Delta Variant in Mexico. Viruses, 14 (6), 1165.
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52 - Zarate,S., Taboada,B., Munoz-Medina,J.E., Isa,P., Sanchez-Flores,A., Boukadida,C., Herrera-Estrella,A., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Gomez-Gil,B., Salas-Lais,A.G., Santacruz-Tinoco,C.E., Montoya-Fuentes,H., ALvarado-Yaah,J.E., Molina-Salinas,G.M., Espinoza-Ayala,G.E., Enciso-Moreno,J.A., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Moreno-Contreras,J., Garcia-Lopez,R., Rivera-Gutierrez,X., Comas-Garcia,A., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., del Angel,R.M., Vazquez-Perez,J.A., Matias-Florentino,M., Perez-Garcia,M., Avila-Rios,S., Castelan-Sanchez,H.G., Delaye,L., Martinez-Castilla,L.P., Escalera-Zamudio,M., Lopez,S., Arias,C.F. (2022). The Alpha Variant (B.1.1.7) of SARS-CoV-2 Failed to Become Dominant in Mexico. Microbiology Spectrum, 10 (2), e0224021.
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Artículo
57 - Rodriguez-Maldonado,A.P., Vazquez-Perez,J.A., Cedro-Tanda,A., Taboada,B., Boukadida,C., Wong-Arambula,C., Nunez-Garcia,T.E., Cruz-Ortiz,N., Barrera-Badillo,G., Hernandez-Rivas L., Lopez-Martinez,I., Mendoza-Vargas,A., Reyes-Grajeda,J.P., Alcaraz,N., Penaloza-Figueroa,F., Gonzalez-Barrera,D., Rangel-DeLeon,D., Herrera-Montalvo,L.A., Mejia-Nepomuceno,F., Hernandez-Teran,A., Mujica-Sanchez,M., Becerril-Vargas,E., Martinez-Orozco,J.A., Perez-Padilla,R., Salas-Hernandez,J., Sanchez-Flores,A., Isa,P., Matias-Florentino,M., Avila-Rios,S., Munoz-Medina,J.E., Grajales-Muniz,C., Salas-Lais,A.G., Santos Coy-Arechavaleta,A., Hidalgo-Miranda,A., Arias,C.F., Ramirez-Gonzalez,J.E. (2021). Emergence and spread of the potential variant of interest (VOI) B.1.1.519 of SARS-CoV-2 predominantly present in Mexico. Archives of Virology, 166, 3173-3177.
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59 - Taboada-Ramirez,B., Zarate,S., Isa,P., Boukadida,C., Vazquez-Perez,J.A., Munoz-Medina,J.E., Ramirez-Gonzalez,J.E., Comas-Garcia,A., Grajales-Muniz,C., Rincon-Rubio,A., Matias-Florentino,M., Sanchez-Flores,A., Mendieta-Condado,E., Verleyen,J., Barrera-Badillo,G., Hernandez-Rivas,L., Mejia-Nepomuceno,F., Martinez-Orozco,J.A., Becerril-Vargas,E., Lopez,S., Lopez-Martinez,I., Avila-Rios,S., Arias,C.F. (2021). Genetic Analysis of SARS-CoV-2 Variants in Mexico during the First Year of the COVID-19 Pandemic. Viruses, 13 (11), 2161.
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60 - Aguado-Garcia,Y., Taboada,B., Moran,P., Rivera-Gutierrez,X., Serrano-Vazquez,A., Isa,P., Rojas-Velazquez,L., Perez-Juarez,H., Lopez,S., Torres,J., Ximenez,C., Arias,C.F. (2020). Tobamoviruses can be frequently present in the oropharynx and gut of infants during their first year of life. Scientific Reports, 10 (1), 13595.
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Artículo
62 - Deng,X.D., Achari,A., Federman,S., Yu,G., Somasekar,S., Bartolo,I., Yagi,S., Mbala-Kingebeni,P., Kapetshi,J., Ahuka-Mundeke,S., Muyembe-Tamfum,J.J., Ahmed,A.A., Ganesh,V., Tamhankar,M., Patterson,J.L., Ndembi,N., Mbanya,D., Kaptue,L., McArthur,C., Munoz-Medina,J.E., Gonzalez-Bonilla,C.R., Lopez,S., Arias,C.F., Arevalo,S., Miller,S., Stone,M., Busch,M., Hsieh,K., Messenger,S., Wadford,D.A., Rodgers,M., Cloherty,G., Faria,N.R., Theze,J., Pybus,O.G., Neto,Z., Morais,J., Taveira,N., Hackett,R., Chiu,C.Y. (2020). Metagenomic sequencing with spiked primer enrichment for viral diagnostics and genomic surveillance. Nature Microbiology, 5, 443?454.
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66 - Moreno-Contreras,J., Espinoza,M.A., Sandoval-Jaime,C., Cantu-Cuevas,M.A., Baron-Olivares,H., Ortiz-Orozco,O.D., Munoz-Rangel,A.V., Hernandez-de la Cruz M., Eroza-Osorio,C.M., Arias,C.F., Lopez,S. (2020). Saliva sampling and its direct lysis, an excellent option to increase the number of SARS CoV2 diagnostic tests in settings with supply shortages. Journal of Clinical Microbiology, 58 (10), 01659-20.
Artículo
67 - Taboada,B., Vazquez-Perez,J.A., Munoz-Medina,J.E., Ramos-Cervantes P., Escalera-Zamudio,M., Boukadida,C., Sanchez-Flores,A., Isa,P., Mendieta-Condado E., Martinez-Orozco,J.A., Becerril-Vargas,E., Salas-Hernandez,J., Grande,R., Gonzalez-Torres,C., Gaytan-Cervantes,F.J., Vazquez,G., Pulido,F., Araiza-Rodriguez A., Garces-Ayala F., Gonzalez-Bonilla,C.R., Grajales-Muniz C., Borja-Aburto,V, Barrera-Badillo G., Lopez,S., Hernandez-Rivas L., Perez-Padilla,R., Lopez-Martinez,I, Avila-Rios,S., Ruiz-Palacios,G., Ramirez-Gonzalez,J.E., Arias,C.F. (2020). Genomic Analysis of Early SARS-CoV-2 Variants Introduced in Mexico. Journal of Virology, 94 (18), e01056-20.
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82 - Taboada,B., Isa,P., Gutierrez-Escolano,A.L., del Angel,R.M., Ludert,J.E., Vazquez,N., Tapia-Palacios,M.A., Chavez,P., Garrido,E., Espinosa,A.C., Eguiarte,L.E., Lopez,S., Souza,V., Arias,C.F. (2018). The Geographic Structure of Viruses in the Cuatro Cienegas Basin, a Unique Oasis in Northern Mexico, Reveals a Highly Diverse Population on a Small Geographic Scale. Applied and Environmental Microbiology, 84 (11), e00465-18.
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88 - Faria, N.R., Quick, J., Claro, I.M., Theze, J., de Jesus, J.G., Giovanetti, M., Kraemer, M.U.G., Hill, S.C., Black, A., da Costa, A.C., Franco, L.C., Silva, S.P., Wu, C.H., Raghwani, J., Cauchemez, S., du, Plessis L., Verotti, M.P., de Oliveira, W.K., Carmo, E.H., Coelho, G.E., Santelli, A.C.F.S., Vinhal, L.C., Henriques, C.M., Simpson, J.T., Loose, M., Andersen, K.G., Grubaugh, N.D., Somasekar, S., Chiu, C.Y., Munoz-Medina, J.E., Gonzalez-Bonilla, C.R., Arias, C.F., Lewis-Ximenez, L.L., Baylis, S.A., Chieppe, A.O., Aguiar, S.F., Fernandes, C.A., Lemos, P.S., Nascimento, B.L.S., Monteiro, H.A.O., Siqueira, I.C., de Queiroz, M.G., de Souza, T.R., Bezerra, J.F., Lemos, M.R., Pereira, G.F., Loudal, D., Moura, L.C., Dhalia, R., Franca, R.F., Magalhaes, T., Marques, E.T., Jr., Jaenisch, T., Wallau, G.L., de Lima, M.C., Nascimento, V., de Cerqueira, E.M., de Lima, M.M., Mascarenhas, D.L., Neto, J.P.M., Levin, A.S., Tozetto-Mendoza, T.R., Fonseca, S.N., Mendes-Correa, M.C., Milagres, F.P., Segurado, A., Holmes, E.C., Rambaut, A., Bedford, T., Nunes, M.R.T., Sabino, E.C., Alcantara, L.C.J., Loman, N.J., Pybus, O.G. (2017). Establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas. Nature, 546 (7658), 406-410.
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Asesor: Lotina Hennsen, Blas

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