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Doctorado, Doctor en Biotecnología
, Otra, 2017
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27
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Artículo
1 -
Garcia-Lopez,R.
,
Taboada,B.
,
Zarate,S.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Salas-Lais,A.G.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Boukadida,C.
,
Vazquez-Perez,J.A.
,
Gomez-Gil,B.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Arias,C.F.
(2024)
.
Exploration of low-frequency allelic variants of SARS-CoV-2 genomes reveals coinfections in Mexico occurred during periods of VOCs turnover
.
Microbial Genomics
,
10
(3),
001220
.
Artículo
2 -
Garcia-Lopez,R.
,
Rivera-Gutierrez,X.
,
Rosales-Rivera,M.
,
Zarate,S.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Roche,B.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Gomez-Gil,B.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Taboada,B.
,
Arias,C.F.
(2023)
.
SARS-CoV-2 BW lineage, a fast-growing Omicron variant from southeast Mexico bearing relevant escape mutations
.
Infection
,
51
,
1549-1555
.
Artículo
3 -
Loza,A.
,
Wong-Chew,R.M.
,
Jimenez-Corona,M.E.
,
Zarate,S.
,
Lopez,S.
,
Ciria,R.
,
Palomares,D.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Isa,P.
,
Taboada,B.
,
Rosales,M.
,
Boukadida,C.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Mojica,N.S.
,
Rivera-Gutierrez,X.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Salas-Lais,A.G.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Vazquez-Perez,J.A.
,
Arias,C.F.
,
Gutierrez-Rios,R.M.
(2023)
.
Two-year follow-up of the COVID-19 pandemic in Mexico
.
Frontiers in Public Health
,
10
,
1050673
.
Artículo
4 -
Taboada,B.I.
,
Zarate,S.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Gomez-Gil,B.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Salas-Lais,A.G.
,
Roche,B.
,
Martinez-Morales,G.
,
Dominguez-Zarate,H.
,
Duque-Molina,C.
,
Aviles-Hernandez,R.
,
Lopez,S.
,
Arias,C.F.
(2023)
.
SARS-CoV-2 Omicron variants BA.4 and BA.5 dominated the fifth COVID-19 epidemiological wave in Mexico
.
Microbial Genomics
,
9
(12),
001120
.
Artículo
5 -
Zarate,S.
,
Taboada,B.
,
Rosales-Rivera,M.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Gomez-Gil,B.
,
Selem-Mojica N.
,
Salas-Lais,A.G.
,
Vazquez-Perez,J.A.
,
Cabrera-Gaytan,D.A.
,
Fernandes-Matano,L.
,
Uribe-Noguez,L.A.
,
Chale-Dzul,J.B.
,
Maldonado Meza,B.I.
,
Mejia-Nepomuceno,F.
,
Perez-Padilla,R.
,
Gutierrez-Rios,R.M.
,
Loza,A
,
Roche,B
,
Lopez,S
,
Arias,C.F
(2023)
.
Omicron-BA.1 Dispersion Rates in Mexico Varied According to the Regional Epidemic Patterns and the Diversity of Local Delta Subvariants
.
Viruses
,
15
(1),
243
.
Revisión
6 -
Garcia-Lopez,R.
,
Laresgoiti-Servitje,E.
,
Lemus-Martin,R.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Sanders-Velez,C.
(2022)
.
The New SARS-CoV-2 Variants and Their Epidemiological Impact in Mexico
.
MBio
,
13
(5),
e0106021
.
Artículo
7 -
Isa,P.
,
Taboada,B.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Boukadida,C.
,
Ramirez-Gonzalez,J.E.
,
Vazquez-Perez,J.A.
,
Hernandez-Teran,A.
,
Romero-Espinoza,J.A.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Grajales-Muniz,C.
,
Rincon-Rubio,A.
,
Matias-Florentino,M.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Mendieta-Condado,E.
,
Barrera-Badillo,G.
,
Lopez,S.
,
Hernandez-Rivas,L.
,
Lopez-Martinez,I.
,
Avila-Rios,S.
,
Arias,C.F.
(2022)
.
Metagenomic analysis reveals differences in the co-occurrence and abundance of viral species in SARS-CoV-2 patients with different severity of disease
.
BMC Infectious Diseases
,
22
(1),
792
.
Artículo
8 -
Taboada,B.
,
Zarate,S.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Boukadida,C.
,
Gomez-Gil,B.
,
Selem-Mojica N.
,
Rosales-Rivera,M.
,
Salas-Lais,A.G.
,
Gutierrez-Rios,R.M.
,
Loza,A.
,
Rivera-Gutierrez,X.
,
Vazquez-Perez,J.A.
,
Avila-Rios,S.
,
Hurtado,J.M.
,
Herrera-Najera,C.I.
,
Nunez-Contreras,J.J.
,
Sarquiz-Martinez,B
,
Garcia-Arias,V.E.
,
Santiago-Mauricio,M.G.
,
Martinez-Miguel,B.
,
Enciso-Ibarra,J.
,
Chaidez-Quiroz,C.
,
Isa,P.
,
Wong-Chew,R.M.
,
Jimenez-Corona,M.E.
,
Lopez,S.
,
Arias,C.F.
(2022)
.
Dominance of Three Sublineages of the SARS-CoV-2 Delta Variant in Mexico
.
Viruses
,
14
(6),
1165
.
Artículo
9 -
Zarate,S.
,
Taboada,B.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Isa,P.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Boukadida,C.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Selem-Mojica N.
,
Rosales-Rivera,M.
,
Gomez-Gil,B.
,
Salas-Lais,A.G.
,
Santacruz-Tinoco,C.E.
,
Montoya-Fuentes,H.
,
ALvarado-Yaah,J.E.
,
Molina-Salinas,G.M.
,
Espinoza-Ayala,G.E.
,
Enciso-Moreno,J.A.
,
Gutierrez-Rios,R.M.
,
Loza,A.
,
Moreno-Contreras,J.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Rivera-Gutierrez,X.
,
Comas-Garcia,A.
,
Wong-Chew,R.M.
,
Jimenez-Corona,M.E.
,
del Angel,R.M.
,
Vazquez-Perez,J.A.
,
Matias-Florentino,M.
,
Perez-Garcia,M.
,
Avila-Rios,S.
,
Castelan-Sanchez,H.G.
,
Delaye,L.
,
Martinez-Castilla,L.P.
,
Escalera-Zamudio,M.
,
Lopez,S.
,
Arias,C.F.
(2022)
.
The Alpha Variant (B.1.1.7) of SARS-CoV-2 Failed to Become Dominant in Mexico
.
Microbiology Spectrum
,
10
(2),
e0224021
.
Artículo
10 -
Bikel,S.
,
Lopez-Leal,G.
,
Cornejo-Granados,F.
,
Gallardo-Becerra,L.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Sanchez,F.
,
Equihua-Medina,E.
,
Ochoa-Romo,J.P.
,
Lopez-Contreras,B.E.
,
Canizales-Quinteros,S.
,
Hernandez-Reyna,A.
,
Mendoza-Vargas,A.
,
Ochoa-Leyva,A.
(2021)
.
Gut dsDNA virome shows diversity and richness alterations associated with childhood obesity and metabolic syndrome
.
iScience
,
24
(8),
102900
.
Artículo
11 -
Garcia-Lopez,R.
,
Cornejo-Granados,F.
,
Lopez-Zavala,A.A.
,
Cota-Huizar,A.
,
Sotelo-Mundo,R.R.
,
Gomez-Gil,B.
,
Ochoa-Leyva,A.
(2021)
.
OTUs and ASVs Produce Comparable Taxonomic and Diversity from Shrimp Microbiota 16S Profiles Using Tailored Abundance Filters
.
Genes (Basel)
,
12
(4),
564
.
Artículo
12 -
Gallardo-Becerra,L.
,
Cornejo-Granados,F.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Valdez-Lara,A.
,
Bikel,S.
,
Canizales-Quinteros,S.
,
Lopez-Contreras,B.E.
,
Mendoza-Vargas,A.
,
Nielsen,H.
,
Ochoa-Leyva,A.
(2020)
.
Metatranscriptomic analysis to define the Secrebiome, and 16S rRNA profiling of the gut microbiome in obesity and metabolic syndrome of Mexican children
.
Microbial Cell Factories
,
19
(1),
61
.
Artículo
13 -
Garcia-Lopez,R.
,
Cornejo-Granados,F.
,
Lopez-Zavala,A.A.
,
Sanchez-Lopez,F.
,
Cota-Huizar,A.
,
Sotelo-Mundo,R.R.
,
Guerrero,A.
,
Mendoza-Vargas,A.
,
Gomez-Gil,B.
,
Ochoa-Leyva,A.
(2020)
.
Doing More with Less: A Comparison of 16S Hypervariable Regions in Search of Defining the Shrimp Microbiota
.
Microorganisms
,
8
(1).
Artículo
14 -
Mendez-Perez,R.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Bautista-Lopez,J.S.
,
Vazquez-Castellanos,J.
,
Alvarez-Gonzalez,C.
,
Pena-Marin,E.
,
Baltierra-Trejo,E.
,
Adams-Schroeder,R.
,
Dominguez-Rodriguez,V.
,
Melgar-Valdes,C.
,
Martinez-Garcia,R.
,
Moya,A.
,
Gomez-Cruz,R.
(2020)
.
High-throughput sequencing of the 16S rRNA gene to analyze the gut microbiome in juvenile and adult tropical gar (Atractosteus tropicus)
.
Latin American Journal of Aquatic Research
,
48
(3),
456-479
.
*
Artículo
15 -
Amaretti,A.
,
Gozzoli,C.
,
Simone,M.
,
Raimondi,S.
,
Righini,L.
,
Perez-Brocal,V.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Moya,A.
,
Rossi,M.
(2019)
.
Profiling of Protein Degraders in Cultures of Human Gut Microbiota
.
Frontiers in Microbiology
,
10
.
*
Revisión
16 -
Garcia-Lopez,R.
,
Perez-Brocal,V.
,
Moya,A.
(2019)
.
Beyond cells - The virome in the human holobiont
.
Microbial Cell
,
6
(9),
373-396
.
*
Artículo
17 -
Garcia-Lopez,R.
,
Vazquez-Castellanos,J.F.
,
Moya,A.
(2015)
.
Fragmentation and coverage variation in viral metagenome assemblies, and their effect in diversity calculations
.
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
,
3
,
141
.
*
Artículo
18 -
Perez-Brocal,V.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Nos,P.
,
Beltran,B.
,
Moret,I.
,
Moya,A.
(2015)
.
Metagenomic Analysis of Crohn's Disease Patients Identifies Changes in the Virome and Microbiome Related to Disease Status and Therapy, and Detects Potential Interactions and Biomarkers
.
Inflammatory Bowel Diseases
,
21
(11),
2515-2532
.
*
Artículo
19 -
Garcia-Lopez,R.
,
Moya,A.
,
Bagan,J.V.
,
Perez-Brocal,V.
(2014)
.
Retrospective case-control study of viral pathogen screening in proliferative verrucous leukoplakia lesions
.
Clinical Otolaryngology
,
39
(5),
272-280
.
*
Revisión
20 -
Gonzalez-Candelas,F.
,
Bracho,M.A.
,
Comas,I.
,
Auria,G.D.
,
Dzunkova,M.
,
Garcia,R.
,
Gosalbes,M.J.
,
Isaac,S.
,
Latorre,A.
,
Lopez-Labrador,F.X.
,
Galindo,J.A.P.
,
Palero,F.
,
Perez-Brocal,V.
,
Perez-Cobas,A.E.
,
Sanchez-Buso,L.
,
Silva,F.J.
,
Vazquez-Castellanos,J.F.
,
Moya,A.
(2014)
.
Estudios de epidemiología molecular en población inmigrante en España
.
Revista Espanola de Salud Publica
,
88
(6),
819-828
.
*
Artículo
21 -
Vazquez-Castellanos,J.F.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Perez-Brocal,V.
,
Pignatelli,M.
,
Moya,A.
(2014)
.
Comparison of different assembly and annotation tools on analysis of simulated viral metagenomic communities in the gut
.
BMC Genomics
,
15
,
37
.
*
Articulo
22 -
Perez-Brocal,V.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Vazquez-Castellanos,J.F.
,
Nos,P.
,
Beltran,B.
,
Latorre,A.
,
Moya,A.
(2013)
.
Study of the Viral and Microbial Communities Associated With Crohn's Disease: A Metagenomic Approach
.
Clinical and Translational Gastroenterology
,
4
,
e36
.
*
Artículo
23 -
Garcia-Lopez,R.
,
Perez-Brocal,V.
,
Diez-Domingo,J.
,
Moya,A.
(2012)
.
Gut Microbiota in Children Vaccinated with Rotavirus Vaccine
.
Pediatric Infectious Disease Journal
,
31
(12),
1300-1302
.
*
Artículo
24 -
Quinto-Cortes,C.D.
,
Arriola,L.A.
,
Garcia-Hughes,G.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Molina,D.P.
,
Flores,M.
,
Palacios,R.
,
Pinero,D.
(2010)
.
Genetic Characterization of Indigenous Peoples from Oaxaca, Mexico, and Its Relation to Linguistic and Geographic Isolation
.
Human BiologyHum.Biol.
,
82
(4),
409-432
.
*
Ver publicaciones anteriores
Capítulos
Capítulo internacional
25 -
Garcia-Lopez,R.
(2018)
.
Construction of a Comprehensive Database from the Existing Viral Sequences Available from the International Nucleotide Sequence Database Collaboration
.
Methods in Molecular Biology 1838.
231-243
,
1838
.
*
Otras publicaciones
Preprint
26 -
Taboada,B.
,
Zarate,S.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Munoz-Medina,J.
,
Gomez-Gil,B.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Salas-Lais,A.G.
,
Roche,B.
,
Martinez-Morales,G.
,
Dominguez-Zarate,H.
,
Duque-Molina,C.
,
Aviles-Hernandez,R.
,
Lopez,S.
,
Arias,C.F.
(2023)
.
SARS-CoV-2 Omicron variants BA.4 and BA.5 dominated the fifth COVID-19 epidemiological wave in Mexico
.
Authorea
,
Preprint
.
Preprint
27 -
Garcia-Lopez,R.
,
Rivera-Gutierrez,X.
,
Rosales-Rivera,M.
,
Taboada,B.
,
Zarate,S.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Roche,B.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Gomez-Gil,B.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Arias,C.F.
(2022)
.
SARS-CoV-2 BW.1, a fast-growing Omicron variant from southeast Mexico bearing relevant escape mutations
.
Research Square
,
Preprint 21 Nov
.
2024
Artículo
28 -
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,
Taboada,B.
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Zarate,S.
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Munoz-Medina,J.E.
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,
Herrera-Estrella,A.
,
Boukadida,C.
,
Vazquez-Perez,J.A.
,
Gomez-Gil,B.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Arias,C.F.
.
Exploration of low-frequency allelic variants of SARS-CoV-2 genomes reveals coinfections in Mexico occurred during periods of VOCs turnover
.
Microbial Genomics
,
10
(3),
001220
.
2023
Artículo
29 -
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,
Rivera-Gutierrez,X.
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Rosales-Rivera,M.
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Roche,B.
,
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,
Gomez-Gil,B.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Taboada,B.
,
Arias,C.F.
.
SARS-CoV-2 BW lineage, a fast-growing Omicron variant from southeast Mexico bearing relevant escape mutations
.
Infection
,
51
,
1549-1555
.
Artículo
30 -
Loza,A.
,
Wong-Chew,R.M.
,
Jimenez-Corona,M.E.
,
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Lopez,S.
,
Ciria,R.
,
Palomares,D.
,
Garcia-Lopez,R.
,
Isa,P.
,
Taboada,B.
,
Rosales,M.
,
Boukadida,C.
,
Herrera-Estrella,A.
,
Mojica,N.S.
,
Rivera-Gutierrez,X.
,
Munoz-Medina,J.E.
,
Salas-Lais,A.G.
,
Sanchez-Flores,A.
,
Vazquez-Perez,J.A.
,
Arias,C.F.
,
Gutierrez-Rios,R.M.
.
Two-year follow-up of the COVID-19 pandemic in Mexico
.
Frontiers in Public Health
,
10
,
1050673
.
Artículo
31 -
Taboada,B.I.
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,
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,
Martinez-Morales,G.
,
Dominguez-Zarate,H.
,
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,
Lopez,S.
,
Arias,C.F.
.
SARS-CoV-2 Omicron variants BA.4 and BA.5 dominated the fifth COVID-19 epidemiological wave in Mexico
.
Microbial Genomics
,
9
(12),
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Uribe-Noguez,L.A.
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Chale-Dzul,J.B.
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Mejia-Nepomuceno,F.
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,
Loza,A
,
Roche,B
,
Lopez,S
,
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.
Omicron-BA.1 Dispersion Rates in Mexico Varied According to the Regional Epidemic Patterns and the Diversity of Local Delta Subvariants
.
Viruses
,
15
(1),
243
.
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Authorea
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MBio
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13
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