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Artículos
Revisión in press
1 - Badreldin,M., Salas-Ambrosio,P., Ayala,M., Harisson,S., Bonduelle,C. (2024). Synthesis of Polypeptides by Ring-opening Polymerization: A Concise Review.
Current Organic Chemistry,
22 March [Online first].
Artículo
2 - Nanjareddy,K., Guerrero-Carrillo,M.F., Lara,M., Arthikala,M.K. (2024). Genome-wide identification and comparative analysis of the Amino Acid Transporter (AAT) gene family and their roles during Phaseolus vulgaris symbioses.
Functional and Integrative Genomics,
24 (2),
47.
Artículo in press
3 - Rafiei,N., Alishah,Aratboni H., Alemzadeh,A., Saavedra-Alonso,S., Razi,H., Morones-Ramirez,J.R. (2024). Nano-Regulation of Gene Expression in Chlamydomonas reinhardtii: Harnessing AuNPs for Remotely Switchable Lipid Biosynthesis via Antisense Oligonucleotides.
ACS Synthetic Biology,
Mar 28 [Online ahead of print].
*
Artículo
4 - Pina-Gonzalez,A.M., Castelan-Sanchez,H.G., Hurtado-Ramirez,J.M., Lopez-Leal,G. (2024). Campylobacter prophage diversity reveals pervasive recombination between prophages from different Campylobacter species.
Microbiology Spectrum,
12 (1),
e0279523.
Artículo protocolo
5 - Pacheco,R., Estrada-Navarrete,G., Solis-Miranda,J., Nava,N., Juarez-Verdayes,M.A., Ortega-Ortega.Y., Quinto,C. (2024). A comprehensive, improved protocol for generating common bean (Phaseolus vulgaris L.) transgenic hairy roots and their use in reverse-genetics studies.
PLoS ONE,
19 (2),
e0294425.
Artículo
6 - Ortiz-Vasco,C.C., Moreno,S., Quintero-Navarro,L.A., Rojo-Rodriguez,J.B., Espin,G. (2024). The stringent response regulates the poly-Iý-hydroxybutyrate (PHB) synthesis in Azotobacter vinelandii.
PLoS ONE,
19 (4),
e0299640.
Artículo
7 - Olivares-Hernandez,R., Riano-Umbarila,L., Becerril,B., Alagon-Cano,A., Vazquez-Lopez,H. (2024). Pharmacokinetic evaluation of a single chain antibody fragment against scorpion toxins in sheep.
Toxicon,
242,
107691.
Artículo
8 - Olaguez-Gonzalez,J.M., Schaeffer,S.E., Breton-Deval,L., Alfaro-Ponce,M., Chairez,I. (2024). Assessment of machine learning strategies for simplified detection of autism spectrum disorder based on the gut microbiome composition.
Neural Computing and Applications,
36,
8163?8180.
Artículo
9 - Neri-Castro,E., Zarzosa,V., Benard-Valle,M., Rodriguez-Solis,A.M., Hernandez-Orihuela,L., Ortiz-Medina,J.A., Alagon,A. (2024). Quantifying venom production: A study on Micrurus snakes in Mexico.
Toxicon,
240,
107658.
Artículo
10 - Muriel-Millan,L.F., Montelongo-Martinez,L.F., Gonzalez-Valdez,A., Bedoya-Perez,L.P., Cocotl-Yanez,M., Soberon-Chavez,G. (2024). The alternative sigma factor RpoS regulates Pseudomonas aeruginosa quorum sensing response by repressing the pqsABCDE operon and activating vfr.
Molecular Microbiology,
121 (2),
291-303.
*
Artículo
11 - Ramos-Leon,J., Valencia,C., Gutierrez-Mariscal,M., Rivera-Miranda,D.A., Garcia-Melendrez,C., Covarrubias,L. (2024). The loss of antioxidant activities impairs intestinal epithelium homeostasis by altering lipid metabolism.
Experimental Cell Research,
437 (1),
113965.
Artículo
12 - Mohanty,G., Sanchez-Cardenas,C., Paudel,B., Tourzani,D.A., Salicioni,A.M., Santi,C.M., Gervasi,M.G., Pilsner,J.R., Darszon,A., Visconti,P.E. (2024). Differential role of bovine serum albumin and HCO3- in the regulation of GSK3 alpha during mouse sperm capacitation.
Molecular Human Reproduction,
30 (3),
gaae007.
Artículo
13 - Miranda-Blancas,R., Rodriguez-Lima,O., Garcia-Gutierrez,P., Flores-Lopez,R., Jimenez,L., Zubillaga,R.A., Rudino-Pinera,E., Landa,A. (2024). Biochemical characterization and gene structure analysisA?of the 24-kDa glutathione transferase sigma from Taenia solium.
FEBS Open Bio,
14 (5),
726-739.
Artículo
14 - Mendoza-Tobar,L.L., Clement,H., Arenas,I., Guerrero-Vargas,J.A., Sepulveda-Arias,J.C., Corzo,G. (2024). An overview of some enzymes from buthid scorpion venoms from Colombia: Centruroides margaritatus, Tityus pachyurus and Tityus n. sp. aff. Metuendus.
Journal of Venomous Animals and Toxins including Tropical Diseases.,
30.
Articulo
15 - Mendoza-Tobar,L.L., Clement,H., Arenas,I., Guerrero-Vargas,J.A., Hernandez-Orihuela,L., Cardoso-Arenas,S., Sepulveda-Arias,J.C., Corzo,G. (2024). Antimicrobial, toxicological, and antigenic characteristics of three scorpion venoms from Colombia: Centruroides margaritatus, Tityus pachyurus and Tityus n. sp. aff. metuendus.
Acta Tropica,
252,
107134.
Artículo
16 - Maruri-Lopez,I., Romero-Contreras,Y.J., Napsucialy-Mendivil,S., Gonzalez-Perez,E., Aviles-Baltazar,N.Y., Chavez-Martinez,A.I., Flores-Cuevas,E.J., Schwan-Estrada,K.R.F., Dubrovsky,J.G., Jimenez-Bremont,J.F, Serrano,M. (2024). A biostimulant yeast, Hanseniaspora opuntiae, modifies Arabidopsis thaliana root architecture and improves the plant defense response against Botrytis cinerea.
Planta,
259 (3),
53.
Artículo
17 - Maldonado-Bravo,R., Villasenor,T., Pedraza-Escalona,M., Perez-Martinez,L., Hernandez-Pando,R., Pedraza-Alva,G. (2024). Negative Regulation of Autophagy During Macrophage Infection by Mycobacterium bovis BCG via Protein Kinase C Activation.
International Journal of Molecular Sciences,
25 (6),
3145.
Artículo
18 - Luna-Bulbarela,A., Romero-Gutierrez,M.T., Tinoco-Valencia,R., Ortiz,E., Martinez-Romero,M.E., Galindo,E., Serrano-Carreon,L. (2024). Response of Bacillus velezensis 83 to interaction with Colletotrichum gloeosporioides resembles a Greek phalanx-style formation: a stress resistant phenotype with antibiosis capacity.
Microbiological Research,
280,
127592.
Artículo
19 - Lopez-Sanchez,R., Rebollar,E.A., Gutierrez-Rios,R.M., Garciarrubio,A., Juarez,K., Segovia,L. (2024). Metagenomic analysis of carbohydrate-active enzymes and their contribution to marine sediment biodiversity.
World Journal Of Microbiology & Biotechnology,
40 (3),
95.
Artículo
20 - Ramirez-Rico,G., Martinez-Castillo,M., Ruiz-Mazon,L., Meneses-Romero,E.P., Flores-Palacios,J.A., Diaz-Aparicio,E., Abascal,E.N., de la Garza,M. (2024). Identification, Biochemical Characterization, and In Vivo Detection of a Zn-Metalloprotease with Collagenase Activity from Mannheimia haemolytica A2.
International Journal of Molecular Sciences,
25 (2),
1289.
Artículo
21 - Rautenberger,R., Detain,A., Skjanes,K., Schulze,P., Kiron,V., Morales-Sanchez,D. (2024). Growth strategies of Chlorella vulgaris in seawater for a high production of biomass and lipids suitable for biodiesel.
Algal Research,
77,
103360.
Artículo
22 - Lara,A.R., Utrilla,J., Martinez,L.M., Krausch,N., Kaspersetz,L., Hidalgo,D., Cruz-Bournazou,N., Neubauer,P., Sigala,J.C., Gosset,G., Buchs,J. (2024). Recombinant protein expression in proteome-reduced cells under aerobic and oxygen-limited regimes.
Biotechnology and Bioengineering,
121 (4),
1216-1230.
Artículo
23 - Sandoval-Hernandez,M.A., Fierro,N.A., Veytia-Bucheli,J.I., Alvarado-Velazquez,D.A., Aleman-Navarro,E., Melchy-Perez,E., Auvynet,C., Imaz-Rosshandler,I., Carneiro,J., Perez-Rueda,E., Rosenstein,Y. (2024). Differential Impact of CD43 and CD28 on T-Cell Differentiation Depending on the Order of Engagement with the TCR.
International Journal of Molecular Sciences,
25 (6),
3135.
Revisión in press
24 - Zambrano-Tipan,D., Narvaez-Padilla,V., Reynaud,E. (2024). Escargot a Snail superfamily member and its multiple roles in Drosophila melanogaster development.
Journal of Cellular Physiology,
Apr 4 [Online ahead of print].
Artículo in press
25 - Wright,G.D., Thompson,K.A., Reis,Y., Bischof,J., Hockberger,P.E., Itano,M.S., Yen,L., Adelodun,S.T., Bialy,N., Brown,C.M., Chaabane,L., Chew,T.L., Chitty,A.I., De,Niz M., Ellenberg,J., Engelbrecht,L., Fabian-Morales,E., Fazeli,E., Fernandez-Rodriguez,J., Ferrando-May,E., Fletcher,G., Galloway,G.J., Guerrero,A., Jacobs,C.A., Jayasinghe,S., Kable,E., Kitten,G.T., Komoto,S., Ma,X., Marques,J.A., Millis,B.A., Miranda,K., JohnO'Toole,P., Olatunji,S.Y., Paina,F., Pollak,C.N., Prats,C., Rahmoon,M.A., Reiche,M.A., Riches,J.D., Rossi,A.H., Salamero,J., Thiriet,C., Terjung,S., Vasconcelos,A.D.S., Keppler,A. (2024). Recognising the importance and impact of Imaging Scientists: Global guidelines for establishing career paths within core facilities.
Journal of Microscopy,
May 1 [Online ahead of print[.
Artículo
26 - Wang,Z., Yang,Y., Li,S., Ma,W., Wang,K., Soberon,M., Yan,Sh., Shen,J., Francis,F., Bravo,A., Zhang,J. (2024). JAK/STAT signaling regulated intestinal regeneration defends insect pests against pore-forming toxins produced by Bacillus thuringiensis.
PLoS Pathogens,
24 (20),
e1011823.
Artículo
27 - Valdez-Cruz,N.A., Rosiles-Becerril,D., Martinez-Olivares,C.E., Garcia-Hernandez,E., Cobos-Marin,L., Garzon,D., Lopez-Salas,F.E., Zavala,G., Luviano,A., Olvera,A., Alagon,A., Ramirez,O.T., Trujillo-Roldan,M.A (2024). Oral administration of a recombinant modified RBD antigen of SARS-CoV-2 as a possible immunostimulant for the care of COVID-19.
Microbial Cell Factories,
23 (1),
41.
Artículo
28 - Uribe-Vazquez,B., Diaz-Vilchis,A, Avila-Linares,A., Saab-Rincon,G, Marin-Tovar,Y., Flores,H, Pastor,N, Huerta-Miranda,G, Rudino-Pinera,E., Soberon,X (2024). Characterization of a catalase-peroxidase variant (L333V-KatG) identified in an INH-resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolate.
Biochemistry and Biophysics Reports,
37,
101649.
Artículo
29 - Soria,S., Carreon-Rodriguez,O.E., de Anda,R., FLORES,N., Escalante,A., Bolivar,F. (2024). Transcriptional and Metabolic Response of a Strain of Escherichia coli PTS(-) to a Perturbation of the Energetic Level by Modification of [ATP]/[ADP] Ratio.
BioTech (Basel),
13 (2),
10.
Artículo
30 - Serrano-Fujarte,I., Calva,E., Garcia-Dominguez,J., Ortiz-Jimenez,S., Puente,J.L. (2024). Population structure and ongoing microevolution of the emerging multidrug-resistant Salmonella Typhimurium ST213.
npj Antimicrobials and Resistance,
2,
10.
Artículo
31 - Santamaria,R.M., Estrada,K., Lopez,M.E., Rojas,E., Martinez,G., Alcala,Y., Rojas,C., Alvarez,J.A., Lira,J.J., Santamaria,T.V., Sanchez-Flores,A., Figueroa,J.V. (2024). Comparative Transcriptome Analysis of Babesia bigemina Attenuated Vaccine and Virulent Strains of Mexican Origin.
Vaccines (Basel),
12 (3),
309.
Artículo
32 - Sanchez-Reyes,A., Fernandez-Lopez,M.G. (2024). Sketched reference databases for genome-based taxonomy and comparative genomics [Bases de dados de referencia esbosados para taxonomia baseada em genoma e genomica comparativa].
Brazilian Journal of Biology,
84,
e256673
.
Artículo
33 - Rendon-Luna,D.F., Arroyo-Mosso,I.A., De Luna-Valenciano,H., Campos,F., Segovia,L., Saab-Rincon,G., Cuevas-Velazquez,C.L., Reyes,J.L., Covarrubias,A.A. (2024). Alternative conformations of a group 4 Late Embryogenesis Abundant protein associated to its in vitro protective activity.
Scientific Reports,
14 (1),
2770.
Artículo
34 - Sanchez-Guevara,Y., Oliver,E.I., Nishigaki,T. (2024). Ca2+ concentrations in mouse sperm mitochondria fluctuate according to the cytosol.
Reproduction,
167 (2),
e230237.
Revisión
35 - Rosales-Vega,M., Resendez-Perez,D., Vazquez,M. (2024). Antennapedia: The complexity of a master developmental transcription factor.
Genesis,
62 (1),
e23561.
Article
36 - Roman-Dominguez,L., Salazar-Leon,J, Meza-Sosa,K.F, Perez-Martinez,L, Pedraza-Alva,G (2024). Adipose tissue IL-18 production is independent of caspase-1 and caspase-11.
Immunity, inflammation and disease,
12 (4),
e1241.
Artículo
37 - Rodriguez-Vargas,A., Franco-Vasquez,A.M., Triana-Ceron,M., Alam-Rojas,S.N., Escobar-Wilches,D.C., Corzo,G., Lazcano-Perez,F., Arreguin-Espinosa,R., Ruiz-Gomez,F. (2024). Immunological Cross-Reactivity and Preclinical Assessment of a Colombian Anticoral Antivenom against the Venoms of Three Micrurus Species.
Toxins (Basel),
16 (2),
104.
Artículo in press
38 - Rodriguez-Mejia,J.L., Hidalgo-Manzano,I.A., Muriel-Millan,L.F., Rivera-Gomez,N., Sahonero-Canavesi,D.X., Castillo,E., Pardo-Lopez,L. (2024). A Novel Thermo-Alkaline Stable GDSL/SGNH Esterase with Broad Substrate Specificity from a Deep-Sea Pseudomonas sp.
Marine Biotechnology,
May 1 [Online ahead of print].
Artículo
39 - Rios-Guzman,J.C., Alonso-Vargas,M., Cadena-Ramirez,A., Juarez-Lopez,K., Portillo-Torres,L.A. (2024). Enhanced denitrification in Paracoccus denitrificans PD1222 by electrical field application [Mejora de la desnitrificación de Paracoccus denitrificans PD1222 mediante aplicación de campo eléctrico].
Revista Mexicana de Ingeniera Quimica,
23 (1),
Bio24136.
Artículo
40 - Rios,F., Uriostegui-Arcos,M., Zurita,M. (2024). Transcriptional Stress Induces the Generation of DoGs in Cancer Cells.
Non-coding RNA,
10 (1),
5.
Artículo
41 - Restano-Cassulini,R., Olamendi-Portugal,T., Riano-Umbarila,L., Zamudio,F.Z., Delgado-Prudencio,G., Becerril,B., Possani,L.D. (2024). Characterization of Sodium Channel Peptides Obtained from the Venom of the Scorpion Centruroides bonito.
Toxins (Basel),
16 (3),
125.
Artículo
42 - Lopez-Roblero,A., Martinez-Cano,D.J., Diego-Garcia,E., Guillen-Navarro,G.K., Isa,P., Zarza,E (2024). Metagenomic analysis of plant viruses in tropical fresh and wastewater.
Environmental DNA,
6 (1),
e416.
Articulo in press
43 - Lara,A.R., Kunert,F., Vandenbroucke,V., Taymaz-Nikerel,H., Martinez,L.M., Sigala,J.C., Delvigne,F., Gosset,G., Buchs,J. (2024). Transport-controlled growth decoupling for self-induced protein expression with a glycerol repressible genetic circuit.
Biotechnology and Bioengineering,
Mar 12 [Online ahead of print].
Artículo
44 - Bellver-Sanchis,A., Avila-Lopez,P.A., Tic,I., Valle-Garcia,D., Ribalta-Vilella,M., Labrador,L., Banerjee,D.R., Guerrero,A., Casadesus,G., Poulard,C., Pallas,M., Grinan-Ferre,C. (2024). Neuroprotective effects of G9a inhibition through modulation of peroxisome-proliferator activator receptor gamma-dependent pathways by miR-128.
Neural Regeneration Research,
19 (11),
2532-2542.
Artículo
45 - de Oliveira,J.L., Gomez,I., Sanchez,J., Soberon,M., Polanczyk,R.A., Bravo,A. (2024). Performance insights into spray-dryer microencapsulated Bacillus thuringiensis cry pesticidal proteins with gum arabic and maltodextrin for effective pest control.
Applied Microbiology and Biotechnology,
108 (1),
181.
Artículo
46 - Garay,E., Whelan,S.P.J., DuBois,R.M., O'Rourke,S.M., Salgado-Escobar,A.E., Munoz-Medina,J.E., Arias,C.F., Lopez,S. (2024). Immune response to SARS-CoV-2 variants after immunization with different vaccines in Mexico.
Epidemiology and Infection,
152,
e30.
Revisión
47 - Gallardo-Becerra,L., Cervantes-Echeverria,M., Cornejo-Granados,F., Vazquez-Morado,L.E., Ochoa-Leyva,A. (2024). Perspectives in Searching Antimicrobial Peptides (AMPs) Produced by the Microbiota.
Microbial Ecology,
87 (1),
8.
Artículo
48 - Franco-Vasquez,A.M., Lazcano-Perez,F., Mejia-Sanchez,M.A., Corzo,G., Zamudio,F., Carbajal-Saucedo,A., Roman-Gonzalez,S.A., Gomez-Manzo,S., Arreguin-Espinosa,R. (2024). Structural, biochemical and immunochemical characterization of an acidic phospholipase A2 from Lachesis acrochorda (Viperidae: Crotalinae) venom.
Toxicon,
237,
107528.
Artículo
49 - Fleitas,O., Fontes,W., de Souza,C.M., Da Costa,M.C., Cardoso,M.H., Castro,M.S., Sousa,M.V., Ricart,C.A.O., Ramada,M.H.S., Duque,H.M., Porto,W.F., Silva,O.N., Franco,O.L. (2024). A proteomic perspective on the resistance response of Klebsiella pneumoniae to antimicrobial peptide PaDBS1R1.
Journal of Antimicrobial Chemotherapy,
79 (1),
112-122.
*
Artículo
50 - Estrada,K., Garciarrubio,A., Merino,E. (2024). Unraveling the Plasticity of Translation Initiation in Prokaryotes: Beyond the Invariant Shine-Dalgarno Sequence.
PLoS ONE,
19 (1),
e0289914.
Artículo
51 - Escalante,A., Astudillo,F., Larios,V., FLORES,N., Gosset,G., Bolivar,F. (2024). The complete genome of Escherichia coli JM101 assembled with a combination of Nanopore and Illumina platforms.
Microbiology Resource Announcements,
13 (2),
e0097323.
Artículo
52 - Dorantes-Torres,C., Carrera-Reyna,M., Santos,W., Sanchez-Lopez,R., Merino,E. (2024). PhyloString: A web server designed to identify, visualize, and evaluate functional relationships between orthologous protein groups across different phylogenetic lineages.
PLoS ONE,
19 (1),
e0297010.
Artículo
53 - de la Cruz,M., Kunert,F., Taymaz-Nikerel,H., Sigala,J.C., Gosset,G., Buchs,J., Lara,A.R. (2024). Increasing the Pentose Phosphate Pathway Flux to Improve Plasmid DNA Production in Engineered E. coli.
Microorganisms,
12 (1),
150.
Artículo in press
54 - Garcia-Ledesma,J.D., Cardenas-Torres,L., Martinez-Aguilar,L., Chavez-Martinez,A.I., Lozano,L., Lopez-Lara,I.M., Geiger,O. (2024). Phosphatidylcholine-deficient suppressor mutant of Sinorhizobium meliloti, altered in fatty acid synthesis, partially recovers nodulation ability in symbiosis with alfalfa (Medicago sativa).
Plant Journal,
Feb 11 [Online ahead of print].
Artículo protocolo
55 - Cruz-Cano,R., Kolb,M., Saldana-Vazquez,R.A., Breton-Deval,L., Cruz-Cano,N., Aldama-Cervantes,A. (2024). Existing evidence on the use of environmental DNA as an operational method for studying rivers: a systematic map and thematic synthesis.
Environmental Evidence,
13 (1),
2.
Artículo
56 - Cruz-Bautista,R., Zelayran-Aguero,A., Ruiz-Villafan,B., Escalante-Lozada,A., Rodriguez-Sanoja,R., Sanchez,S. (2024). An overview of the two-component system GarR/GarS role on antibiotic production in Streptomyces coelicolor.
Applied Microbiology and Biotechnology,
108 (1),
306.
Artículo
57 - Cristiano-Fajardo,S.A., Barron-Reyes,D., Flores,C., Luna-Bulbarela,A, Soriano-Pena,E, Tinoco-Valencia,R, Galindo,E, Serrano-Carreon,L (2024). Production of poly-gamma-glutamic acid and spore formation in Bacillus velezensis 83 are affected by acidic growing conditions and glucose uptake rate.
Journal of Chemical Technology & Biotechnology,
99 (3),
609-617.
Artículo
58 - Cortes-Avalos,D., Borges-Farias,A., Romero-Gonzalez,L.E., Lara-Ochoa,C., Villa-Tanaca,L., Garcia del Portillo,F., Lopez-Guerrero,V., Bustamante,V.H., Perez-Rueda,E., Ibarra,J.A. (2024). Interactions between the AraC/XylS-like transcriptional activator InvF of Salmonella Typhimurium, the RNA polymerase alpha subunit and the chaperone SicA.
Scientific Reports,
14 (1),
156.
Artículo
59 - Castrejon-Carrillo,S., Morales-Moreno,L.A., Rodriguez-Alegria,M.E., Zavala-Padilla,G.T., Bello-Perez,L.A., Moreno-Zaragoza,J., Lopez-Munguia,A. (2024). Insights into the heterogeneity of levan polymers synthesized by levansucrase Bs-SacB from Bacillus subtilis 168.
Carbohydrate Polymers,
323,
121439.
Artículo
60 - Cardona-Echavarria,M.C, Santillan,C, Miranda-Blancas,R, Stojanoff,V, Rudino-Pinera,E (2024). Unveiling success determinants for AMB-assisted phase expansion of fusion proteins in ARP/wARP.
Journal of Structural Biology,
216 (2),
108089.
Revisión
61 - Bouvier,C., Lawrence,R., Cavallo,F., Xolalpa,W., Jordan,A., Hjerpe,R., Rodriguez,M.S. (2024). Breaking Bad Proteins-Discovery Approaches and the Road to Clinic for Degraders.
Cells,
13 (7),
578.
Artículo in press
62 - Bourke,L.A., Zdenek,C.N., Huynh,T.M., Hodgson,W.C., Alagon,A., Castro,E.N., Jones,J., Fry,B.G. (2024). Fangs and Foliage: Unearthing the Haemotoxic Secrets of Cannabis-Dwelling Rattlesnakes.
Toxicon,
107756.
Artículo
63 - Garcia,T., Castillo,T., Flores,C., Galindo,E. (2024). Characterization of a new HUP+ Phaeodactylum tricornutum strain having improved production of eicosapentaenoic acid (EPA).
Journal of Chemical Technology & Biotechnology,
99 (2),
474-480.
Artículo
64 - Garcia-Lopez,R., Taboada,B., Zarate,S., Munoz-Medina,J.E., Salas-Lais,A.G., Herrera-Estrella,A., Boukadida,C., Vazquez-Perez,J.A., Gomez-Gil,B., Sanchez-Flores,A., Arias,C.F. (2024). Exploration of low-frequency allelic variants of SARS-CoV-2 genomes reveals coinfections in Mexico occurred during periods of VOCs turnover.
Microbial Genomics,
10 (3),
001220.
Artículo
65 - Lacombe,C., Aleman-Navarro,E., Drujon,T., Martinez-Osorio,V., Sachon,E., Melchy-Perez,E., Carlier,L., Fajardo-Brigido,E., Fleury,Y., Piesse,C., Gutierrez-Escobedo,G., de las Penas,A., Castano,I., Desriac,A., Beristain-Hernandez,J.L., Combadiere,C., Rosenstein,Y., Auvynet,C. (2024). Characterization of a New Immunosuppressive and Antimicrobial Peptide, DRS-DA2, Isolated from the Mexican Frog, Pachymedusa dacnicolor.
International Journal of Inflammation,
2024.
Artículo
66 - He,X., Yang,Y., Soberon,M., Bravo,A., Zhang,L., Zhang,J., Wang,Z. (2024). Bacillus thuringiensis Cry9Aa Insecticidal Protein Domain I Helices In3 and In4 Are Two Core Regions Involved in Oligomerization and Toxicity.
Journal of Agricultural and Food Chemistry,
72 (2),
1321-1329.
Artículo
67 - Jimenez-Vazquez,K.R., Lopez-Hernandez,J., Garcia-Cardenas,E., Pelagio-Flores,R., Lopez-Bucio,J.S., Canedo-Texon,A., Ibarra-Laclette,E., Lopez-Bucio,J. (2024). The plant growth promoting rhizobacterium Achromobacter sp. 5B1, rescues Arabidopsis seedlings from alkaline stress by enhancing root organogenesis and hormonal responses.
Microbiological Research,
281,
127594.
*
Artículo
68 - Jablonski,M., Luque,G.M., Gomez-Elias,M., Sanchez-Cardenas,C., Xu,X., de la Vega-Beltran,J.L., Corkidi,G., Linares,A., Abonza,V., Krapf,D., Krapf,D., Darszon,A., Guerrero,A., Buffone,M.G. (2024). Reorganization of the Flagellum Scaffolding Induces a Sperm Standstill Required for Fertilization.
Elife,
13,
RP93792.
Artículo
69 - Ide-Perez,M.R., Sanchez-Reyes,A., Folch-Mallol,J.L., Sanchez-Carbente,M.D.R. (2024). Exophiala chapopotensis sp. nov., an extremotolerant black yeast from an oil-polluted soil in Mexico; phylophenetic approach to species hypothesis in the Herpotrichiellaceae family.
PLoS ONE,
19 (2),
e0297232.
Artículo
70 - Huang,G., Cong,Z., Liu,Z., Chen,F., Bravo,A., Soberon,M., Zheng,J., Peng,D., Sun,M. (2024). Silencing Ditylenchus destructor cathepsin L-like cysteine protease has negative pleiotropic effect on nematode ontogenesis.
Scientific Reports,
14 (1),
10030.
Artículo
71 - Hoyos-Gonzalez,N., Ochoa-Leyva,A., Benitez-Cardoza,C.G., Brieba,L.G., Lukaszewicz,G., Trasvina-Arenas,C.H., Sotelo-Mundo,R.R. (2024). Identification of a cryptic functional apolipophorin-III domain within the Prominin-1 gene of Litopenaeus vannamei.
Comparative Biochemistry and Physiology - B Biochemistry and Molecular Biology,
270 (Feb-Mar),
110928.
Artículo
72 - Hinojosa-Cruz,A., Diaz-Sanchez,A.G, Diaz-Vilchis,A., Gonzalez-Segura,L. (2024). Structural and functional properties of uridine 5'-monophosphate synthase from Coffea arabica.
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Artículo
73 - Hernandez-Guzman,J., Arias,C.F., Lopez,S., Sandoval-Jaime,C. (2024). Nucleolin-RNA interaction modulates rotavirus replication.
Journal of Virology,
98 (2),
e0167723.
Artículo
74 - Hernandez,H.O., Montoya,F., Hernandez-Herrera,P., Diaz-Guerrero,D.S., Olveres,J., Bloomfield-Gadelha,H., Darszon,A., Escalante-Ramirez,B., Corkidi,G. (2024). Feature-Based 3D+t Descriptors of Hyperactivated Human Sperm Beat Patterns.
Heliyon,
10 (5),
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Artículo
75 - Gutierrez-Rodriguez,E.K., Astudillo-Melgar,F., Larios,V., Bolivar,F., Escalante,A., Giles-Gomez,M. (2024). The complete genome of two Lactiplantibacillus plantarum isolates from the traditional Mexican fermented pulque beverage assembled with a combination of PacBio and Illumina platforms.
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13 (1),
e00985-23.
Revisión
76 - Garcia-Paz,F.M., Del Moral,S., Morales-Arrieta,S., Ayala,M., Trevino-Quintanilla,L.G., Olvera-Carranza,C. (2024). Multidomain chimeric enzymes as a promising alternative for biocatalysts improvement: a minireview.
Molecular Biology Reports,
51 (1),
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Artículo
77 - Guillen-Chable,F., Valdez Iuit,J.O., Avila Castro,L.A., Rosas,C., Merino,E., Rodriguez-Escamilla,Z., Martinez-Nunez,M.A. (2024). Geographical distribution of mobile genetic elements in microbial communities along the Yucatan coast.
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Artículo
78 - Guadarrama-Perez,V., Aguilar,C., Porras-Sanjuanico,A., Merino,E., Ramirez,O.T., Barona-Gomez,F., Palomares,L.A. (2024). Expression in CHO cells of a bacterial biosynthetic pathway producing a small non-ribosomal peptide aldehyde prevents proteolysis of recombinant proteins.
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Artículo
79 - Guadarrama-Martinez,A., Neri-Castro,E., Boyer,L., Alagon,A. (2024). Variability in antivenom neutralization of Mexican viperid snake venoms.
PLoS Neglected Tropical Diseases,
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Artículo
80 - Gonzalez-Valdez,A., Escalante,A., Soberon-Chavez,G. (2024). Heterologous production of rhamnolipids in Pseudomonas chlororaphis subsp chlororaphis ATCC 9446 based on the endogenous production of N-acyl-homoserine lactones.
Microbial Biotechnology,
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Artículo
81 - Gomez-Sanchez,I., Castelan-Sanchez,H.G., Martinez-Castilla,L.P., Hurtado-Ramirez,J.M., Lopez-Leal,G. (2024). Genetic insights into the microevolutionary dynamics and early introductions of human monkeypox virus in Mexico.
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82 - Godinez-Perez,C.M., Loza,A., Hurtado,J.M., Gutierrez-Rios,R.M. (2024). The benzoyl-CoA pathway serves as a genomic marker to identify the oxygen requirements in the degradation of aromatic hydrocarbons.
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Artículo
83 - Ghosh,A., Lopez,T., Green,K., Arias,C.F., DuBois,R.M. (2024). Structure and antigenicity of the divergent human astrovirus VA1 capsid spike.
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Artículo
84 - Garcia-Soto,I., Formey,D., Mora-Toledo,A., Cardenas,L., Aragon,W., Tromas,A., Duque-Ortiz,A., Jimenez-Bremont,J.F., Serrano,M. (2024). AtRAC7/ROP9 Small GTPase Regulates A. thaliana Immune Systems in Response to B. cinerea Infection.
International Journal of Molecular Sciences,
25 (1),
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Artículo
85 - Zarzosa,V., Lomonte,B., Zamudio,F., Ponce-Lopez,R., Olvera-Rodriguez,F., Borja,M., Alagon,A., Neri-Castro,E. (2024). Venom of the neotropical rattlesnake, Crotalus culminatus: Intraspecific variation, neutralization by antivenoms, and immunogenicity in rabbits.
Biochimie,
216,
160-174.
Publicaciones institucionales: 81
Capítulos
Memoria in extenso
1 - Diaz-Guerrero,D.S., Montoya,F., Hernandez,H.O., Hernandez-Herrera,P., Darszon,A., Corkidi,G. (2024). Computation of Human-Sperm Local Flagellar Instantaneous Velocity. Flores-Cuatle,J.D.J.A. XLVI Mexican Conference on Biomedical Engineering. IFMBE Proceedings vol 96.
59-66,
Cham: Springer.
Capítulo internacional in press
2 - Dubrovsky,J.G., Rodriguez-Alonso,G. (2024). The Root Apical Meristem. Beeckman,T. Plant Roots Hidden Half.
5th.
Capitulo aceptado
3 - Lazcano,I., Joseph-Bravo,P., Orozco,A. (2024). The evolution of hypothalamic-pituitary-thyroid axis. Oliviera,R.F. Evolutionary and comparative neuroendocrinology.
Master Class Series.
Capitulo nacional
4 - Puga,C., Valderrama,B. (2024). La politica cientifica de la 4T y la resiliencia de una comunidad. Monsivais-Carillo,A. ¿Cómo se sostiene la democracia? La resiliencia democrática en México. .
Capítulo internacional in press
5 - Sanchez-Cardenas,C., Hernandez-Cruz,A., Visconti,P.E., Darszon,A. (2024). Real-time acrosome reaction and intracellular calcium recordings in mice sperm. Spermatology: Methods and Protocols Book. .
Publicaciones institucionales: 5
Tesis
1 - Perez Martinez, Victoria (2024). Efecto de la eliminación de la expresión de la ecto-enzima de inactivación de la Hormona liberadora de la Tirotropina sobre la respuesta del eje tiroideo y del metabolismo periférico en ratones.
Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas,
Licenciatura,
UAEM.
*
2 - Rodriguez Torres, Luis Miguel (2024). Determinacion de la estructura y componentes de biopelicula de diferentes cepas de Geobacter sulfurreducens sobre diversas superficies.
Instituto de Biotecnologia,
Maestría en Ciencias,
UNAM.
Asesor: Juarez Lopez, Katy
3 - Lopez Meza, Jesus Manuel (2024). Construccion de una biblioteca de mutantes del citocromo P450BM3 para hidroxilar acido p-cumarico.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Saab Rincon, Gloria
4 - Davila Delgado, Raul (2024). Evaluacion de la endocitosis de PvSymrk en pelos radicales de frijol en respuesta a la incubacion con rhizobia.
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Sanchez Lopez, Rosana
5 - Bucarey Ruiz, Francisca Catalina Anastassia (2024). Analisis de la expresion de los factores de transcripcion pvMYB200 y pvMYB700 en raices de Phaseolus vulgaris y su participacion al inicio de la nodulacion.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Sanchez Lopez, Rosana
6 - Estrada Guerra, Karel Johan (2024). Análisis in silico de las secuencias de unión a ribosoma que definen el inicio de la traducción en procariontes.
Instituto de Investigacion en Ciencias Basicas y Aplicadas,
Doctorado en Ciencias,
UAEM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
7 - Gonzaga Perez, Miriam Citlalli (2024). Estudio de la funcion de AmrZ en la sintesis de alginato en Azotobacter vinelandii.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Nunez Lopez, Cinthia Ernestina
8 - Ramirez Serrano, Cristina Elizabeth (2024). Evaluacion farmacologica de una mezcla de compuestos activos presentes en malva parviflora en un modelo murino de la enfermedad de Alzheimer.
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Perez Martinez, Leonor
9 - Arreola Barroso, Rodrigo Alejandro (2024). Analisis de los contactos entre aminoacidos para identificar moduladores de la funcion fuera del sitio catalitico de enzimas : el caso de hidrolisis y transglicosidacion en la familia de las glicosido hidrolasas GH13 .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Saab Rincon, Gloria
10 - Gallegos Hernandez, Adrian Salvador (2024). Analisis in vivo de los receptores apn1 y malp de las toxinas cry mediante edicion genetica por crispr-cas9 en aedes aegypti.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Pacheco Guillen, Sabino
11 - Martinez Bahena, Salvador (2024). Generacion semi-racional y seleccion de mutantes afectadas en la sintesis de levanas de alto peso molecular de la levansacarasa LevS de Leuconostoc mesenteroides.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Olvera Carranza, Clarita
12 - Rodriguez Maldonado, Azeret (2024). Ingenieria metabolica en Escherichia coli para la produccion de etanol e hidrogeno a partir de glicerol.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Martinez Jimenez, Alfredo
13 - Rodriguez Gutierrez, Sarahi (2024). Participacion del sistema CRISPR-Cas en la regulacion transcripcional de proteinas de membrana externa de S. Typhi IMSS-1.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Hernandez Lucas, Ismael
14 - Gonzalez Arias, Miguel Angel (2024). Evaluacion comparativa de modelos de lenguaje de proteinas para clasificar betalactamasas y predecir su actividad catalitica.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
15 - Montiel Salgado, Silvia (2024). Sintesis y purificacion parcial de Levan FOS empleando la enzima bifuncional LevB1SacB expresada en Pichia pastoris en un sistema de biocatalisis/fermentacion.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Lopez-Munguia Canales, Agustin
16 - Serrano Gutierrez, Mariela (2024). Identificacion in silico y caracterizacion molecular de la regulacion genetica basada en riboswitches que se transcriben en sentido opuesto al de su gen blanco (antisense-acting riboswitches).
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
17 - Montero Dominguez, Pavel Andrei (2024). Diseño de variantes de la ß-neurotoxina rCssii-RCR que modifiquen el reconocimiento del subtipo hNav1.6 al hNav1.7 con el fin de obtener un péptido con efecto antinociceptivo.
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquímicas,
UNAM.
Asesor: Corzo Burguete, Gerardo Alfono
18 - Rivera Miranda, David Alejandro (2024). Teratomas para estudiar el crecimiento tumoral inducido por los oncogenes E6 y E7 del virus del papiloma humano.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Garcia Melendrez, Celina
Publicaciones institucionales: 16
Otras Publicaciones
Divulgación nacional
1 - Aleman-Navarro,E., Rosenstein,Y. (2024). Pero.. la tuberculosis, ¿no estaba ya erradicada?.
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2 - Quintero Rodriguez,E., Rueda Almazan,J.E., Ortiz Suri,E. (2024). El veneno del alacrán: mitos y realidades.
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71,
4-5.
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3 - Singh,P., Vydyam,P., Fang,T., Kumar,M., Estrada,K., Grande,R., Sanchez-Flores,A., Gonzalez,L.M., Montero,E., Chakravarty,S., Lonardi,S., Berry,V,, Ranwez,V., Carcy,B., Depoix,D., Sanchez,S., Cornillot,E., Abel,S., Ciampossin,L., Lenz,T., Le Roch,K.G., Harb,O.S., Ben Mamoun,C. (2024). Multiomics analysis reveals B. MO1 as a distinct Babesia species and provides insights into its evolution and virulence.
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Preprint posted January 18.
Nacional
4 - Serrano-Gutierrez,M., Merino,E. (2024). Riboswitches antisentido o de cómo la evolución adapta mecanismos de regulación para obtener respuestas antagónicas.
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28 (1),
9-18.
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5 - Sanchez-Flores,A. (2024). Los logros científicos y tecnológicos más importantes del 2023 (segunda parte).
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08 de enero.
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6 - Sanchez-Flores,A. (2024). Los logros científicos y tecnológicos más importantes del 2023 (primera parte).
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02 de enero.
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7 - Rubio-Noguez,D., Breton-Deval,L., Salinas-Peralta,I., Juarez,K., Galicia,L. (2024). Pollution pressure drives microbial assemblages that improve the phytoremediation potential of heavy metals by Ricinus communis.
Research Square,
Preprint posted Feb 26.
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8 - Rojas-Vargas,J.A., Pardo-Lopez,L. (2024). Diseñando un consorcio microbiano.
Ciencia Cakotanu,
4 (4),
2-4.
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9 - Rojas-Vargas,J.A., Pardo-Lopez,L. (2024). El viaje del petróleo en el mar: lo que se esconde bajo la superficie.
La Unión de Morelos,
3 de abril.
Preprint
10 - Ramirez-Bello,I., Lopez,T., Espinosa,R., Ghosh,A., Green,K., Riano-Umbarila,L., Gaspar-Castillo,C., Alpuche-Aranda,C., Lopez,S., DuBois,R., Arias,C.F. (2024). Antigenic determinants of HAstV-VA1 neutralization and their relevance in the human immune response.
bioRxiv,
Preprint posted March 08.
Nacional divulgación
11 - Ramirez Carreto,S., Pando Robles,V. (2024). Las garrapatas: portadoras de patógenos que afectan al ser humano.
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71,
34-36.
Divulgación nacional
12 - Pacheco,R., Quinto,C. (2024). Las fosfolipasas D: gestoras de una interacción benéfica.
Biotecnología en Movimiento.Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM,
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13 - Cervantes-Echeverria,M.J., Jimenez-Rico,M.A., Manzo,R., Hernandez-Reyna,A., Cornejo-Granados,F., Sanchez-Lopez,F., Salazar-Leon,J., Pedraza-Alva,G., Perez-Martinez,L., Ochoa-Leyva,A. (2024). Fecal Virome Transplantation (FVT) from healthy humans remodels the gut bacteriome and virome and reduces metabolic syndrome in mice.
bioRxiv,
Preprint posted February 18.
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14 - Oropeza-Valdez,J.J., Padron-Manrique,C., Vazquez-Jimenez,A., Soberon,X., Resendis-Antonio,O. (2024). Exploring Metabolic Anomalies in COVID-19 and Post-COVID-19: A Machine Learning Approach with Explainable Artificial Intelligence.
bioRxiv,
Preprint posted April 17,
2024.
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15 - Novero,A.G., Torres-Rodriguez,P., de la Vega-Beltran,J.L., Schiavi-Ehrenhaus,L.J., Luque,G.M., Carruba,M., Stival,C., Gentile,I., Ritagliati,C., Santi,C.M., Nishigaki,T., Krapf,D., Buffone,M.G., Darszon,A., Trevino,C.L., Krapf,D. (2024). The sodium-proton exchangers sNHE and NHE1 control plasma membrane hyperpolarization in mouse sperm.
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Preprint posted March 6.
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16 - Neri-Castro,E., Gomez-Zarzosa,V. (2024). Revelando los misterios de las cascabeles de cola larga.
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36.
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17 - Martinez-Anaya,C. (2024). Inmunidad vegetal: Un recorrido a través de las defensas invisibles de las plantas.
La Unión de Morelos,
22 de enero.
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18 - Lugo-Garcia,L.E., Martinez-Anaya,C., Salinas-Castro,A., Landa-Cadena,M.G., Tapia-Vazquez,I. (2024). Combined treatment with Purpureocillum lilacinum MTL01 and Bacillus velezensis 83 reduces galling by Meloidogyne enterolobii and improves flowering in greenhouse-grown tomato.
Research Square,
Preprint posted 14 Feb.
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19 - Hernandez-Garcia,D., Garcia-Melendrez,C., Hernandez-Martinez,R., Collazo-Navarrete,O, Covarrubias,L. (2024). Macrophages allocate independent of apoptosis and produce reactive oxygen species during interdigital phagocytosis.
bioRxiv,
Preprint posted April 22.
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20 - Flores-Alcantar,A. (2024). Alternativas al uso de animales de laboratorio en la investigación.
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36.
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21 - Diaz-Garrido,P., Santacruz-Martinez,E., Arnal,A., Lopez-Charreton,S., Suzan-Azpiri,G. (2024). Descifrando las huellas ocasionadas por infecciones virales.
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22 - Claudio-Piedras,F., Recio,B., Lanz,H., Cime-Castillo,J. (2024). Global 5-methylcytosine-RNA disruption reduces the vectorial competence to DENV2 of heatwave-exposed Aedes aegypti mosquitoes.
bioRxiv,
Preprint posted March 14.
Preprint revisión
23 - Vargas,Y., Castro-Ton,A.E., Charli,J.L., Rodriguez-Rodriguez,A., Uribe,R.M., Joseph-Bravo,P. (2024). Thyrotropin Releasing Hormone and Food-Intake in Mammals: An Update.
Preprints.org,
Preprint posted 9th May.
Publicaciones institucionales: 23